1 解决

Hic挂载时 K值选择

  • _He. 2025-04-23 08:48
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IBD计算

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LD绘图

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基因结构注释效果不理想

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用GATK call 变异的时候，分染色体还是很慢，能不能增加线程或别的改进的方法。

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如何合并两个单细胞测序中的两个子集？

  • Zzz 2025-04-26 22:41
2 解决

10 参考咱们的T2T组装课程 进行基因组组装后，染色体出现了一个超级染色体，各染色体大小分布非常不均匀

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10 老师您好，我在运行megahit对200多个环境微生物宏基因组数据进行组装时，megahit报错Exit code -9

  • Zz1 2025-05-27 11:03
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老师您好，单倍型分析的图是这样的，我关注的是蓝色框起来的标记，这个snp处于一个高度连锁的区域吗，属于左边的block还是右边的block呢

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IBD 计算2

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重测序

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5 老师您好，我在运行megahit对200多个环境微生物宏基因组数据进行组装时，megahit报错Exit code -9

  • Zz1 2025-05-27 10:13
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采用你们课程的：Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以及Rscript $scriptdir/qq_plot.r制作Manhattan图和QQ图后，Manhattan图最高的SNP仅仅显示半圆（如下图），请问如何修复（就是修改可视化Manhattan图的纵坐标）

  • John 2025-03-12 15:35
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老师 就是我做到基因流tremix哪里的时候 生成后面的文件是空的怎么解决呀，还有就是我做到dadi哪里的时候 有两个参数需不需要改一下呀 因为我做的是杜鹃，最后一个问题就是，我红色箭头指出哪里，出现的问题是模型是错误的 ，就一直没有什么文件生成

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组装后的cds.fa文件进行Kegg注释

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R包在安装BiocManager::install("biostrings")出错

2 解决

5 老师，我运行这条命令报错了，请问哪里出问题了 ，感谢老师

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IBD 计算2

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3 gff3_file_to_proteins.pl 报错

  • Dg 2025-01-10 16:59
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并行运行