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重测序var_density.R脚本报错

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重复序列分析

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今天下午docker突然不能用了是什么原因？？

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之前用的咱们的docker今天突然不能用了，是什么原因？

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DNAsp软件为什么有时候文件上传不了，显示未将对象引用设置到对象的实例，同一个文件有时候可以

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叶绿体比较基因组分析你好，我组装好的Fasta文件是一条一条的，课程里重复序列和多态性分析用的示例文件是总all.fasta,我需要怎么能整合起来，一条条好像也分析不成

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使用Launch_PASA_pipeline.pl 脚本报错

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10 在做HIC PRO,如果是双酶切。 那ligation site应该怎么写

  • 2025-11-12 15:28
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在PAV分析绘制热图的时候，运行R脚本出现如下错误，请问怎么解决？这个aplot安装包安装也一直安装不了

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用iqtree对SNP构建系统进化树出现提示

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泛基因家族分析数据准备里面，运行命令保留最长转录本结果都会报错，说是找不到文件，但文件存在在data目录下， ./.gff3.gz does not exist，Please verify the input file name/path

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泛基因家族分析的数据准备的里面有一个加载全局变量env.sh,请问这个有什么作用？里面改没改这个Ref=B73为自己的物种有什么区别呢，修改了要不要加这个基因组的具体路径？

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老师您好，基因家族鉴定的时候，要求使用 GA 阈值重新运行 hmmsearch 分析保守结构域。请问这个GA阈值是什么啊，应该怎么操作呢

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泛基因家族分析PAV_gene.list中基因数量，少于gene.pep.fa中序列的数目

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泛基因家族分析-SV和表达量

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请问win11家庭版上刚开始基于hyper-v安装了docker，后来调整docker设置变成基于WSL2安装docker，然后请问这样可行吗？怎么使用？

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组学大讲堂的一个T2T组装培训课，在进行组装前先除去了和细胞器DNA高度相关的reads。但是我看现在大部分的文章没有特别处理细胞器的DNA，是在组装的过程中已经被除掉了吗？

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请问现在T2T的组装，还需要先除掉和细胞器DNA相关的reads再进行组装吗？组学大讲堂的课里面除掉了相关的reads。但是我看现在的论文，似乎都没有对细胞器的DNA进行单独的处理。

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PGGB泛基因组报错

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在全基因组选择育种课程中，所有需要预测的样本（在 pred_ID.csv 中列出的ID），必须已经存在于那个巨大的基因型文件 imputed_snp.raw 中，是否就意味着我只能预测现有群体的缺失部分？我需要预测新的群体，那这 pred_ID.csv文件该如何编写？