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重测序

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泛基因家族分析pav运行 R脚本运行出现问题

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线粒体基因组组装挑选contigs的标准是什么？

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老师，我提取cds ，pep用基因的ID，作为序列的ID命令。运行出来"No such file or directory; can't open file ./.longest_isoform.gff3"但是我打开输出文件看是有数据的。是不是不用管No such file or direc...提示

  • aa1 2025-01-09 16:36
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单细胞测序FindAllmarkers

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服务器连接断网

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老师 就是 您在重测序课程里面里面用vcftools工具过滤和群体遗传过滤的条件有一点不一样 那个才是对的或者两个都对 我截屏放一次下面啦 您看一下

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老师我在做泛基因家族分析里面的泛基因列表构建，生成last.txt文件非常慢，帮忙修改命令

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GWAS分析的教程中06.impute的beagle填充出现问题

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docker search镜像时报错

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重测序BWA比对率低

  • BJFU 2024-12-30 08:50
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群体遗传分析数据过滤

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基因组组装着丝粒问题

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5 docker打不开镜像

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这个脚本如果直接从ensamble下载cds和pep还需要去提取吗，是不是可以直接转换格式

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SoupX去除污染RNA

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命令行复制

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vcftools 过滤等位基因。 老师，用的同样是vcftools过滤indel snp后生成的vcf.gz，然后进行等位基因过滤，生成文件很小是为啥啊，我看过滤条件也不严格啊

  • Max 2024-12-21 21:52
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3 为什么我的WGCNA分析运行到这一步就卡住了，但是显示分析中，WGCNA分析如何筛选数据啊，恳请各位大佬帮帮忙

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宏基因组预测后使用salmon计算物种丰度的TPM值可以直接相加吗？