04.snp_indel.sh

第四个脚本出现 下面的错误是什么原因?attachments-2026-09-rRDkggq96aba7568748df.PNG

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2 个回答

Ti Amo

41行,nucmer比对被kill了。
无法看到具体原因,一般这种比对被终止常见原因是内存耗尽。

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随风

内存有300G 还不够吗?如果我去掉--maxmatch 参数就可以运行,nucmer  -g 1000 -c 90 -l 40 -t 10 -p $query ref.fa  $query.fa,不知道这样有没有影响?怎么样可以减少内存使用,需要-t 10 参数改小点吗?


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  • 随风 提出于 2026-09-28 22:11

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