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老师 就是在做群体structure分析的时候，clean.vcf.gz文件是下面这中格式，代码需要怎么修改啊，您看一下谢谢，

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老师，您好，我在运行gatk的HaplotypeCaller时主脚本通过 SLURM 调度系统提交作业，使用 GNU Parallel 并行处理多个样本并调用 HaplotypeCaller 脚本，目前运行了约六七个小时，我的工作日志.err和.out都为空这是正常的吗？

  • Geő 2025-05-14 17:06
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泛基因组分析教程中的env.sh文件运行自己相应物种时，里面的命令行是不是要进行修改如下图所示

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我用gemma做小麦的gwas分析，到最后一步生成曼哈顿图时出错，是因为参考基因组的染色体编号与基因型数据对应不上吗，应该怎么老师解答

  • 2025-07-10 03:28
2 解决

泛基因家族分析

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nextpolish报错

  • _He. 2025-07-08 01:11
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Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/search?q=omicsclass&n=25": dialing index.docker.io:443 container via direct connect

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单细胞测序高级分析中RNA速率分析的重复序列怎么生成

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16S课程 02.feature_table #16S 分析 deblur

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老师您好，进行比较基因组分析时候，单拷贝直系同源群为0，后续的分析就出现了报错，这是什么原因，是我选择的基因组不合适还是其他原因。

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对宏基因组的分类和功能数据去除低丰度数据时，论文中经常采用0.1%,0.01%或者不说明，我可以采用其他取值不在文中说明吗

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基因单倍型分析报错

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请问这样的QQ图说明GWAS结果是否合适的呢？

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老师您好，我在运行OrthoFinder2时，出现下面报错，请老师解答

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用ALLHIC挂载时，划分Group出现问题

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cellranger count 报错：job failed in stage code怎么解决

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GWAS分析的表型数据不符合正态分布，但是极值材料表型是真实存在的，所以是保留原始数据还是用IRNT转换表型值或者剔除不符合正态分布的值呢

  • 2025-07-11 23:22
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客服说泛基因组分析中26Pan-genes.list对应泛基因集分析章节中的final.last.gene.pair.txt文件，但是两者之间有差异，像是缺了几列是怎么回事，如下面详述，请解答

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GATK 分染色体CALL变异之后怎样合并

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共线性分析，我看文献有说共线区块，我可以通过什么命令来计数？