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泛基因家族分析-SV和表达量

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泛基因家族分析-SV和表达量

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老师您好，做比较基因组分析时，单拷贝同源基因的这个文件是空的Orthogroups_SingleCopyOrthologues，并且orthofinder文件夹也是空的，是什么原因造成的

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老师您可以分享一下buildRepeatSummary.pl脚本嘛

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泛基因家族分析进化树构建

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请问现在T2T的组装，还需要先除掉和细胞器DNA相关的reads再进行组装吗？组学大讲堂的课里面除掉了相关的reads。但是我看现在的论文，似乎都没有对细胞器的DNA进行单独的处理。

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我的关注的头足类和其他贝类的进化关系，涉及5个头足类物种4个其他贝类，基因集这里基本上都包括这五个头足类物种了，是说明头足类物种进化出或者在这些富集基因多的通路上和其他贝类不同了吗？

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Tassel表型文件和基因组文件样本量不一样

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泛基因家族分析-SV和表达量

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老师您好，我运行MCMCtree的时候，为什么程序就不运行

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泛基因家族分析的数据准备的里面有一个加载全局变量env.sh,请问这个有什么作用？里面改没改这个Ref=B73为自己的物种有什么区别呢，修改了要不要加这个基因组的具体路径？

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老师我这里练习之前上课的内容想复制粘贴整个目录，以及创建新的文件夹都显示这个请问应该怎么办呢

  • Nier 2025-09-30 11:07
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老师，就是我在用misa鉴定ssr的时候，把文件输进去出现下面这个问题怎么解决，用你们提供的数据也是一样的问题，我找不到原因

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老师，我做泛基因家族鉴定时，06.SV_analysis最后得到的All.final.sv.out基因结构变异信息只有一条，请问哪里可能有问题

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请问如果系统是windows server 2016版的话安装docker的话应该选择哪个版本呢

  • Nier 2025-12-12 16:07
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da

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单细胞测序cellranger分析

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老师，我想把镜像复制到自己服务器上使用，使用的是singularity run reseq.sif，为何进入容器以后软件都用不了呢，是哪里出了问题？

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泛基因家族分析，核心基因等数量统计

2 解决

10 成功启动镜像，进入容器，把课程资料下载到本地并解压缩，为什么找不到课程资料