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请教用gtf文件获取基因与mRNA的对应关系的问题

biocat 2020-01-08 17:48:38

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基因组信息

.Bubblehead 2019-12-20 20:05:10

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基因组gff文件

.Bubblehead 2019-12-20 11:18:25

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基因家族分析时获取基因与mRNA的对应关系

丶昔阳 2019-12-02 23:21:21

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gff文件里的geneID和CDS,蛋白质里的对不上，下载了好多版本都这样，有什么办法处理一下吗？

Triste 2019-11-29 10:17:28

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删除哪个？

.Bubblehead 2019-11-27 18:52:13

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老师，请问我在做基因组间共线性分析，我的gff 文件，和cds 文件格式如下，如何修改这两个脚本文件get _gene _bed.pl和get _fa _by _bed. pl ，才能提取成功进行下一步分析，谢谢！！

。。。。。 2019-11-11 16:21:26

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哥，您好，如何检查GFF文件里面的mRNA ID是否对应一致，或者如何改脚本，get_gene_weizhi.pl

Ⅶ淼 2019-11-08 10:16:29

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老师您好，我想请问一下用TBtools提取的gff文件做基因结构分析时某个基因显示有13个外显子，但是将这个基因序列提交到NCBI时却显示有12个外显子。请问这是什么情况啊

荀咪 2019-10-25 16:49:05

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gff文件中，左侧第一列中，AC. AP. Mt Pt. Syng~是什么意思，并且AC AP Mt Pt scaffold:syng~在cds pep文件中找不到对于序列

枫 2019-10-18 11:26:37

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mRNA和gene ID不一致如何进行修改

✨Ted先生 2019-09-03 09:17:56

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如何根据注释文件信息，提取并计算基因组相应区域（如CDS，exon，intron）区域的长度？

Mayomics 2019-07-24 17:33:27

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运行geneid2mRNAid时出现以下问题，人类，水稻，玉米基因组就不行，拟南芥，大豆就可以

仰仰 2019-07-22 18:19:38

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老师请问gff文件提前mRNA的id不是数字，是字母，是不是脚本需要换？

守得云开雾现。 2019-05-07 21:22:15

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蛋白序列ID和cds序列ID不一致

追梦 2019-03-20 14:12:43