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提取基因在染色体位置时发现gff3文件中的染色体编号不好理解。疑惑。

星野 2020-05-21 09:32:02

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请问：在做基因家族分析时，只有基因组的fna，和gbff文件，怎么找它的cds和pep呢

所以 2020-04-27 14:18:05

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老师，麻烦问一下制作基因结构图时，gene_exon_info.gff文件始终为空的，

smile悠然 2020-04-21 21:45:57

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老师，如果不在linux运行，在分析外显子时如何获得gff格式的文件，谢谢

秋风 2020-04-10 18:03:00

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使基因ID与parent的ID一致，用sed命令处理完之后发现ID下划线后面与其他ID不一致，是不是需要手动删除？

生信使我快乐 2020-03-10 21:48:13

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mRNA2geneID.txt文件不能正常获得

zhoy 2020-03-09 00:22:26

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老师，请问一下，由于从NCBI下载的数据中的基因、蛋白和染色体名称的不同导致用你给的W.sh文件的脚本提取不出转录本ID，该怎么办？

Stardust 2020-03-04 12:46:12

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染色体出现chr00是什么情况

zhoy 2020-02-26 17:53:08

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请教用gtf文件获取基因与mRNA的对应关系的问题

biocat 2020-01-08 17:48:38

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基因组信息

.Bubblehead 2019-12-20 20:05:10

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基因组gff文件

.Bubblehead 2019-12-20 11:18:25

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基因家族分析时获取基因与mRNA的对应关系

丶昔阳 2019-12-02 23:21:21

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gff文件里的geneID和CDS,蛋白质里的对不上，下载了好多版本都这样，有什么办法处理一下吗？

Triste 2019-11-29 10:17:28

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删除哪个？

.Bubblehead 2019-11-27 18:52:13

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老师，请问我在做基因组间共线性分析，我的gff 文件，和cds 文件格式如下，如何修改这两个脚本文件get _gene _bed.pl和get _fa _by _bed. pl ，才能提取成功进行下一步分析，谢谢！！

。。。。。 2019-11-11 16:21:26