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获取基因与mRNA的对应关系，注意文件中的位置mRNA的位置； #perl script/mRNAid_to_geneid.pl Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 mRNA2geneID.txt

mengjuan 2021-07-06 15:35:41

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老师，我在做基因结构图的时候出现下面的问题，该如何解决

溪晨 2021-07-04 22:16:35

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基因家族分析：要是GFF文件中没有mRNA这一项的话，应该怎么处理加上这一行？我看有加gene这一行的，不知道怎么加mRNA这一项

杨辉 2021-04-22 22:03:09

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基因家族分析：当GFF文件中首行不是所在的染色体而是一个个基因的GFF文件，这种怎么找对应关系啊，或者怎么整成有染色体的

杨辉 2021-04-22 16:43:30

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老师你好，现在脚本运行正常了，但gff文件提前不出来

我是个憨憨 2021-03-29 20:50:53

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GFF文件不能获取基因与mRNA的对应关系文件

zhyx6511 2020-11-14 01:04:39

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利用gff文件提取基因结构，结果文件是空的

Sirius 2020-08-21 00:01:58

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您好老师，我用get_gene_gff.pl提取的基因位置文件gene_chr.txt没有第一列基因ID，并且数量对不上，我只有一百多个基因，它提出了几千条信息，请问这种怎么处理呀？

不悔 2020-08-05 13:57:22

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提取基因在染色体位置时发现gff3文件中的染色体编号不好理解。疑惑。

星野 2020-05-21 09:32:02

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请问：在做基因家族分析时，只有基因组的fna，和gbff文件，怎么找它的cds和pep呢

所以 2020-04-27 14:18:05

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老师，麻烦问一下制作基因结构图时，gene_exon_info.gff文件始终为空的，

smile悠然 2020-04-21 21:45:57

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老师，如果不在linux运行，在分析外显子时如何获得gff格式的文件，谢谢

秋风 2020-04-10 18:03:00

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使基因ID与parent的ID一致，用sed命令处理完之后发现ID下划线后面与其他ID不一致，是不是需要手动删除？

生信使我快乐 2020-03-10 21:48:13

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mRNA2geneID.txt文件不能正常获得

zhoy 2020-03-09 00:22:26

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老师，请问一下，由于从NCBI下载的数据中的基因、蛋白和染色体名称的不同导致用你给的W.sh文件的脚本提取不出转录本ID，该怎么办？

Stardust 2020-03-04 12:46:12