该问题不属于课程范畴。
其中第三条,通常基因组杂合度低于0.5%认为是简单基因组,此时调研图所得到的基因组大小最贴近组装大小。在杂合度1.2%的时候通常建议组装两个单倍型基因组,如果没有做单倍型区分,由于杂合区域的存在,该组装会大于调研图预测基因组大小。
老师您好,请问在论文返修中审稿人问:(1)非编码RNA鉴定的具体功能是什么?What’s the detailed function for the non-coding RNA identification?我在论文中写了有多少个各类的ncrna。请问还需要补充什么呀。(2)该组装高度碎片化,连续序列N50仅为2兆碱基——远低于T2T基因组时代的预期标准。这很可能由于HiFi数据不足(仅约40吉碱基)所致;我们预计≥80吉碱基的HiFi测序读数将显著提升连续性。此外,鉴于该物种的极端杂合性,采用ONT长读长可能获得更优的组装结果。The assembly is highly fragmented, with a contig N50 of only 2 Mb—far below the standard expected in the era of T2T genomes. This is most likely due to insufficient HiFi data (only ~40 Gb); we anticipate that ≥80 Gb of HiFi reads would substantially improve contiguity. Moreover, given the extremely high heterozygosity of this species, using ONT long reads may yield a better assembly. 我的虫子比较小,且是单一源头的克隆群,DNA量不够,只测了30G的hifi,没办法补数据了应该怎么回复。(3)survey结果是0.97G,组装结果是1.15G。杂合1.19。请问怎么回答好一点