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5天前 回答问题

先检查一下绘图的输入文件中这些品系是否数据正常。输入文件中这些品系在那些家族基因中有同源基因

2025-12-03 17:25 回答问题

有可能结构变异未影响基因的保守结构域。也可以做一下其它比较多变异数据的基因组的保守结构域分析。可以定位到基因组具体发生结构变异的家族成员序列上，看基因序列与未变异的基因序列之间的差异

2025-11-20 17:59 回答问题

这个要先确认基因家族的结构域特点，可以看相关文献中鉴定结果的筛选标准。

2025-11-16 08:47 回答问题

镜像和脚本是配套的，不用在容器里面更改R包。可以检查一下镜像和脚本，重新开一个容器运行尝试一

2025-10-31 16:48 回答问题

仔细观察进化树，其实WRKY49是进化支最外侧的分支。加上WRKY12，这种情况会默认范围会包含里侧全部分支。针对这种分支，可以设置WRKY12~WRKY86一组，WRKY49单独一组，其它颜色参数一致就行

2025-10-31 10:14 回答问题

用ggplot2包绘图

2025-10-30 10:52 回答问题

gff文件中缺少基因gene注释信息行，导致gtf文件不标准，出现报错KeyError: 'gene_id'，使得后续无法获取gene_length.txt文件。可以重新找一个存在gene注释信息的基因组。也可以人为添加上相关信息，参考笔记：https://www.omicsclass.com/article/2081

2025-10-29 15:12 回答问题

检查输入文件，两个表达量文件的样本是否一致

2025-10-29 11:24 回答问题

检查一下绘图文件里面是否有2个WRKY56，可以截图发一下