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4天前 回答问题
是根据cds设计引物，cds长度>70就不算太短
4天前 回答问题
可以，确认进程完全停止后，删除所有中间文件，再加入参数--cpus 1 --batch 1000，去运行。随时通过“ps -xf”监控后台进程
4天前 回答问题
看看生成的中间文件大小有没有增长，或者通过“ps -xf”命令查看进程的状态，参考笔记：https://www.omicsclass.com/article/483如果是终止状态的话只能杀死进程重新运行：先删除中间文件，再修改参数--cpus 1，--batch 1000 ，或者先用小数据测试一下。
2026-05-28 14:19 发起提问
2026-04-30 21:51 回答问题
检查一下gff文件的格式是否标准，是不是9列。截图是格式有问题
2026-04-27 13:15 回答问题
检查一下输入文件是否存在
2026-04-27 10:14 回答问题
't' 的符号要用英文单引号
2026-04-24 17:54 回答问题
基因家族分析课程里面不需要下载pfam数据库。在鉴定步骤里只需要下载结构域的隐马尔科夫模型即可
2026-04-21 10:11 回答问题
不是所有的基因家族都存在非常保守的结构域和由结构域构建的HMM模型。这种情况可以不选择hmmer鉴定，只选择blast鉴定的方法。具体可以借鉴该基因家族已发表的相关文献
2026-04-20 09:08 回答问题
检查一下env.sh文件中定义的变量路径正不正确