2025-08-17 20:19 回答问题

看基因组挺大的，放后台过几十分钟再看看。

2025-08-12 10:03 回答问题

1.确认输入all_merge.vcf文件是否是结构变异文件2. 与demo示例数据为参考，确认中间文件格式正确，注意文件格式问题，https://www.omicsclass.com/question/8061/answer/73563. 手动确认泛基因的变异信息，如果同物种的话，变异信息少。也可能结果就一条

2025-08-06 09:19 回答问题

可以 手动修改kaks_greater_than_1_gene_rate.txt，将想删除的成员删除

2025-08-06 09:14 回答问题

根据核心基因的定义确定

2025-08-06 09:09 回答问题

路径写错了。看报错提示，路径demo少写了个“o”

2025-08-05 09:24 回答问题

进化树上默认显示的就是输入序列ID，最简单的方法是改动序列ID，也可以在后续美化时用美化软件修改分支标签

2025-08-05 09:16 回答问题

进化树分析中是提取第一条序列作为泛基因序列进行进化树分析。课程里面也不都是同一品种的

2025-08-04 16:58 回答问题

根据提取的脚本，基因需要提供正负链信息，提取负链基因的启动子序列后需要反向互补，正链基因则不需要。基于此，最终得到的启动子序列都是B端靠近基因ATG的。

2025-08-01 15:10 回答问题

先手动检查一下apple.WRKYgene.list中的基因ID是不是全部在15apple.pan-genes.list文件中出现，能被搜索到，是不是文件内容或者格式有问题，

2025-07-31 17:50 回答问题

可以不写，因为参数会默认clustalw2方法比对。