红橙子
红橙子

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-06-29

向TA求助
222金币数
3400 经验值
1个粉丝
主页被访问 1064 次

最近动态

2天前 发表了文章

2019-09-20 11:05 回答问题

您好,有参转录组结果解读课程和无参转录组结果解读课程很大一部分内容是相似的,如差异分析,注释富集,蛋白互作都是一样的,主要差别在于无参转录组本组装部分,主要是区分好unigene、 cds、orf等概念就没啥问题了。

2019-09-20 11:01 发起提问

2019-09-20 10:59 回答问题

比对率低一般是由于污染、样品测序质量、样品与参考基因组亲缘关系等原因, 你这个样品应该是有问题的,最好先找出问题,然后再考虑是否剔除。

2019-09-20 10:56 发起提问

2019-09-02 21:04 回答问题

应该是有2对基因位置较近,红线两条红线重合了!

2019-09-02 21:03 发起提问

2019-09-02 20:59 回答问题

我觉得问题应该是如何知道在您所研究的物种中有没有人研究过这个基因,既然您知道这个基因,应该是见过其他人报道过该基因,多数是这种情况,当然您也可能扩出了一条未知序列,明确了其具有功能,这就列害了,第一种情况下,您可以在NCBI上检索下看是否有人提交过您所研究物种的该基因序列或论文是否有报道,假如没有,应该是还没人报道过,不排除别人在做或已研究未提交NCBI。

2019-08-29 23:26 回答问题

样品间的相关性反应了样品间的相似情况,即不同样品在表达水平的相似度。相关系数越接近1,样品间的相似度越高,样品间的差异基因越少。生物学重复内样品的相关系数大于生物学重复外样品的相关系数。 转录组测序通常要求设置3个生物学重复样本,如果出现某个样品与组内其它样本相关性不好的情况,可将该样本剔除,再进行差异分析。后期再通过生物学验证手段进行生物学验证,不影响文章发表。

2019-08-29 23:25 发起提问