“LD.p.”是你自己给的输出文件前缀
*.TriangleV.gz 区域内成对的 R^2/D’计算结果
LD.p.site.gz 过滤后剩余的进入计算的 SNPsR ，第一列是chr ，第二列是site（snp所在位置）
你说的LD区块分成两个意思，一个是根据LD衰减图确定LD block大小，在候选SNP左右两侧延申一个LD block所形成的。一个是 在LDBlockShow结果中联系紧密的SNP之间自动会被划定为一个block，这个结果在blocks.gz文件中有所体现。
LD结果原始数据如何看
老师您好，我在进行LD分析时使用了以下命令：
LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \
-Region Chr1:36000000-37000000 -OutPng -SeleVar 2 -InGWAS ld.pvalue.txt
分析后得到两个LD分析的原始数据文件：LD.p.TriangleV和LD.p.site（截图如下）。
想请教一下，这两个文件分别应该如何查看和解读？尤其是LD.p.TriangleV文件中各列数据具体代表什么，以及应该如何理解这些原始数据并根据这些数据理解和确定LD区块？麻烦老师帮忙指点一下，谢谢老师！
