17小时前 回答问题
你这也没在容器里面啊,你如果想进入容器的话需要docker attach 容器ID
2天前 发表了文章
2天前 回答问题
同学,我没有分析你的数据哈,具体情况我不是很清楚,你是自己跑的结构变异注释吗?如果你只用了一个参考基因组构建的注释信息库,你需要通过最后一步把对应家族编号的基因(在参考基因组中)提取出来。如果你是直接从作者那里获取到的结构变异注释结果,可能你需要问问作者相关的信息
4天前 回答问题
同学,VCF 文件属于我们课程之外的内容,如果需要做相关内容分析的话需要联系客服付费购买的:联系客服
6天前 回答问题
foxtail_millet.GRASgene.list,如果只能提供部分SV的结果,用你鉴定到的家族成员的基因
2025-04-17 17:16 回答问题
把你的shell脚本截图看一下
2025-04-17 15:15 回答问题
你为什么要替换你的库文件的内容呢,你直接用库文件做注释就行了,脚本里这里也没有让你修改ID:
2025-04-15 10:54 回答问题
出现上面的warning可能是序列的相似度太高,如果能排除是测序和注释的错误的话,就继续做就可以了,至于构树的时候你用多少基因去构树,树上就会有多少个基因,树上面展示哪些基因取决于你想说明的生物学问题
2025-04-15 09:55 回答问题
你有多少个样本啊,我在课程里面说了要把这个地方改成你对应的样本数+1,你是不是没改,你改一下: awk -F"\t" '{if($0!~/^Fam_N/){for(i=2;i<=你的样本数+1;i++){print $1"\t"$i}}}' PAV_gene.list |sed "s/;$//"|awk -F"\t" '{gsub(";","\n"$1"\t",$0);print}'|awk -F"\t" '{if($2!=""){print}}' > Fam_gene.list
2025-04-14 09:51 回答问题
你看一下你的表型数据里面有没有奇怪的数据,第二例表达量应该都是数值型数据,检查一下有没有混进去奇怪的字符