16S

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关于16S去噪的问题

  • Amber 2022-06-30 17:05:54
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metastat Error in `[.data.frame`(df, , c("#OTU ID", groupA, groupB)) : undefined columns selected Calls: [ -> [.data.frame

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用qiime1 pick otu时，用de novo方法到最后一步时，出现图片的情况，好几个小时都是这样，出了什么问题？

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请问如果其他数据的metadata.tsv与barcode如何做出来？​

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老师您好，我这边在处理扩增子数据分析时，进行OTU分析时不论用哪种方法都会报错“ERROR RAISED DURING STEP:Assign taxonomy” segmentation fault，用您那边提供的样本数据也是有这个报错，请问怎么解决呀！

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16v34区测序碱基数

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老师您好，我根据课程步骤的指令，改不了文件的格式，我能找到format_fa_for_qiime.pl文件，还把它放到了操作的文件夹，但是电脑找不到这个文件，是什么原因呢

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多样性数据实操 OTU注释报错

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视频里面说的 amplicon.demo.tar.gz 和 data base . ta ,这两个压缩包，不知道怎么下载，可以提供一下吗?第一次用这个提问，可能重复提问了，抱歉。

  • 嘉 2020-09-15 16:38:49
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疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析

  • Lynn 2020-03-07 21:00:20
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老师您好！请问一个处理只有5重复，能用这5个重复在MENA中做16S网络图分析吗（相当于MENA分析的样本量为5）？MENA网络图分析对样本量的要求是多少呢？

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用MENA对16S OTU进行网络图分析

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大家好，我第一次注册分子生态网络MENA账号是总是提示邮箱和账号已被用，试了好几次都不行，请求各位大神指点迷津

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用qiime识别16S测序结果的嵌合体（chimera）要多久？为什么等好久没反应，输入命令都变成乱码？

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