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拟时分析筛选出的差异基因数量太少，有没有可以调整的参数去增加筛选数量

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verkko组装后怎么生成.hic和.assembly文件

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tgsgapcloser报错

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文献给的下载基因组网站下载不了花生基因组数据，ensemble下载的信息又不全，咋整啊，老师?

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GWAS分析的问题

  • John 2025-03-10 15:36
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老师您好，我在做泛基因家族分析中存在缺失分析得到的基因家族泛基因编号文件和泛基因列表一样，不知道为什么

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包含内含子的完整基因序列如何得到。

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请问老师，为什么显示找不到文件呢，已经尝试过重新传输文件

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IBD 计算2

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T2T基因组调研图中jellyfish -h和genomescope.R -m 都是设置的10000000，设置的依据是什么，不同作物有差异，怎么选择参数呢

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我在做T2T，docker下载T2T镜像错误

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老师您好，我在进行megahit组装后运行quast.py这段出现报错，查看megahit.log文件后，出现的最后一行command的信息为Exit code -15,请问这是怎么回事呢？

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我输入docker run那条指令后，出现了以下报错，输入docker search omicsclass也出现报错。

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5 原核生物建立基因组索引出现问题，没有gtf在文件

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泛基因集构建中JCVI做共线性分析构建完一半数据报错 core dumped

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课程里使用bracken对kraken结果进行修饰我发现全部都注释到种水平了这个是bracken算法的设置原因吗？

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5 单细胞测序拟时分析没有“seruat”这个包报错

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请问老师。镜像启动是哪里出错了

  • 2025-03-11 21:25
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老师您好，我在运行collapse_samples.py这段代码用于物种注释时出错，出错信息为 qiime.parse.QiimeParseError: No header line was found in mapping file.请问该如何解决？

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老师，您好，我正在泛基因家族分析，想问课程中用到的结构变异的vcf文件all_merge.vcf是泛基因组全基因组范围的变异吗，