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使用单细胞转录组课程中的代码进行GSVA分析时，找不到所关注的通？

  • Zzz 2025-04-26 16:19
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请问，我弄了一个256线程，1t内存的服务器，想处理500G的宏基因组注释，大概需要跑多少天，全套下来

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怎么从全部的300份重测序数据的vcf.gz文件中抽出自己的想要的200份数据

  • Max 2024-12-19 17:16
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Fam_genelist中基因个数超出了所有的鉴定的数据

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二代和三代sv数据合并出现问题，若能回答，万分感谢

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泛基因家族分析分析 pav中统计样本数量

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10 GATK报错Caused by: java.io.IOException: Input/Output error

  • YYJ 2024-12-30 20:45
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老师 我想问一下就是这个snp的统计是哪里呀 我视频里面看啦 说是SNP_gene_ann.stat里面的最后一列total ，但是我统计出来有一千五百多万，才36个个体 会不会太多了呀，还是直接wc -l对vcf文件进行统计呀

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不知道为什么，产生不了unmap文件

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老师，我在做饭基因家族分析，我搜集的基因组的gff3文件，第一列有的是chr有的是基因id，这个会影响后续结果嘛？

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已经windows系统里下载了docker 也打开了，但还是运行不了. doc.sh

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想咨询一下，宏基因组功能注释的视频中，有一步是用cds.fa文件注释物种，想咨询一下，这个物种注释出来后，应该如何计算丰度？是根据前面cds.count来计算吗，这样计算出的物种丰度可靠吗？因为有些物种可能基因很多。

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通过GWAS分析找到显著snp后，对这个snp进行单倍型分析，把群体分为了3种单倍型，结合表型做了显著性分析，发现3种单倍型的表型不存在显著差异，这样的结果说明这个snp是阴性结果吗？

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单细胞测序的细胞通讯分析 cellchat

  • Zzz 2025-04-28 16:55
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10 在国家基因组下载的基因组信息是这样，请问下面这一步该怎么修改

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

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3 基因家族分析 kaks分析

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Use of uninitialized value $id in lc at /share/work/biosoft/perl/perl-5.22.1/lib/site_perl/5.22.1/AGAT/OmniscientI.pm会影响结果吗

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老师您好，在经过您的2024转录代谢培训班后，我自己运行WGCNA是出现卡住的问题

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运行go_enrich.r报错