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基于图形泛基因组文件call取sv的时候，运行命令nohup vg call new_index.giraffe.gbz -r new_index.snarls -k D23.pack -a -A -t 30 -s D23 > D23.vcf 2>call.o &，显示done，但生成的vcf文件里面没有变异位点，只有个头，如截图中所示。这种问题怎么解决呢？

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10 您好，请问SNPT软件失效了

  • cc 2025-12-31 16:09
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建立索引时出现报错，但依旧出现了一些文件，想问问报错原因怎么处理

  • xxx 2026-01-07 15:24
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新上的空间转录组课程可以用于分析华大基因测的数据吗

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泛基因组组装

  • BJFU 2026-03-04 14:58
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泛基因家族分析做PAV绘图时，总共20个样本，每次绘图后就剩19个

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geneflow

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nucmer比对出现问题，导致部分样本没有结果

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微生物共现网络问题

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conda

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但我后面加了$之后它先是报错没有index目录，创建之后运行不报错但没有运行结果

  • xxx 2026-01-06 14:41
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下图的文件是怎么得到的

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你好老师为什么这里无法启动镜像

  • Nier 2025-12-27 18:23
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请问如果系统是windows server 2016版的话安装docker的话应该选择哪个版本呢

  • Nier 2025-12-12 16:07
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泛基因组

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我的all.chr.hmp.txt.gz文件大小是4.6G再跑gapit的模型总报错

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老师下面这个问题怎么解决呀，我换一个物种他就可以完成，

3 解决

我更改文件名之后还是会复制不成功，这条命令应该怎样更改才正确，位置路径在R中显示是home/gene/genome

  • xxx 2026-01-04 15:37
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5 你好，请问你当时提出的那个问题解决了吗，我现在也是卡在这一步了，求指教

  • 2025-12-18 16:02
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随着PCA数目的增多，GWAS峰值越来越高，显著位点越来越少