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单细胞测序数据做聚类分析后图片聚类结果不清晰且很丑，应该调整哪些参数？怎么调整？

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老师，用admixture做群体结构时，可以绘制单独一个k值的结构图吗？另外用代码跑出来的图怎么修改横纵坐标的字体以及大小呢？

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进化树想修改一下分支

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10 有没有大神懂图片上两个公式如何计算

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老师您好，我按照课程提供的流程泡自己的数据，在构建进化树的时候利用run_pipeline.pl -Xmx200G -importGuess $workdir/00.filter/clean.vcf.gz -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这个命令操作的，但生成的supergene里面有好多命名重复，这是怎么回事？由于这个重复就导致我没法做进化树

  • per 2024-06-04 16:19
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请问功能注释里面，想注释KEGG

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请问重测序可以得到某物种的全基因组序列吗，能不能从重测序数据中找到某个基因的完整序列？

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猪单细胞数据差异基因KEGG富集分析

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老师，您好，我做基因家族分析时绘制表达模式热图，因为我的GFF3文件是从ensemble上下载的，发现从NCBI上下载的转录组数据的基因ID与我的基因ID不一致，这时该怎么判断那个是同一个基因呢？

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老师 您说bwa比对哪里 能正常生成，就是在allhic对congtig分group那一步一直出错，我把bwa比对生成文件截图放后面了 老师您看一下

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iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bnni -alrt 1000 --prefix iqtree出现报错

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怎么过滤vcf文件中INFO列中的DP参数？

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老师请问，这种OG0000.。。代表的基因家族扩增还是收缩问题，他们的具体名称在哪里对应查找，比如OG000044代表钙粘蛋白基因家族，还是什么家族有名称吗？

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电脑上无法学习

  • per 2024-07-27 11:16
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5 Treemix分析中无法生成input.frq.strat文件

  • per 2024-06-30 12:11
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基因组组装和注释镜像中bwa报错

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按要求下载完dockerwin11版后不运行怎么回事

  • 2024-05-21 13:03
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老师能把你整个过程执行过的代码发一下吗，一直对着视频找有差别的地方，纠错很麻烦

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5 stairway-plot里的L参数怎么确定？