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在T2T基因组直播课程中基因组hic挂载染色体部分，老师说对于高杂合基因组还需要用一个软件过滤等位基因假信号，是什么软件，我没听清；还有个问题如果只用nextdenevo进行数据校正不组装，那么校正后的数据在哪个文件夹？

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比较基因组学03.Phylo_Tree/aln_out

  • Song 2024-10-03 11:27
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关于代谢组学的原始文件处理

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老师您好，使用beagle 进行基因型填充的时候填充依据是什么啊，是后台有参考数据库吗？

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为什么docker下载不了第三方镜像？显示这样Using default tag: latest What's next: View a summary of image vulnerabilities and recommendations → docker scout quickview biocontainers/samtools Error response from daemo

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Sripts插件缺失，之前下了scripts的文件，然后在本地跑代码的时候跑出来文件发现为0，后找对接老师拿了压缩包，导入后还是不对，后检查，发现还是少了这个插件

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5 老师您好，我使用P-value进行转录组差异基因筛选，被审稿人质疑了，我看到您之前回复2020年的帖子说校正后p值筛选差异基因较少时用P-value也行，这种情况得后期用qpcr验证我数据是准确的是吗，我之前做了qpcr验证，但是用的不是我关注的差异基因，现在也不能补关注基因的定量了。我准备找几篇使用未校正p值的文章加上我之前做的qpcr来解释我的分析是可行的，您觉得这样可以吗？

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有关于GSEA富集分析参数设置

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单细胞高级分析代码的报错求助

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putty 跑保留最长转录本，跑了一两个小时后突然没反应了，出现inactive

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基因组间共线性分析作图问题

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结构变异注释步骤生成文件为空

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老师，在pca分析作图中需要分组文件，如果我的群体没有分组文件，那么应该如何确定分组，是先用structure分析确定最佳分组后再做其他的pca和进化树吗？

  • WHR 2024-09-11 17:51
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老师，我想请问一下这个图一直上升是因为抽平深度不够吗？

  • JACK 2024-09-14 17:39
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提取可靠基因家族成员的结构域序列

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GWAS分析排序后出现sortPositions: false keepDepth: false的报错并且没有结果输出是什么原因

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docker search omicsclass中没有pop-evol-gwas:latest了

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SNP分析软件SNPT最小SNP分析结果疑问

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MCScanX共线性分析

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提取CDS和蛋白序列出错