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在SNPcalling结束后进行合并gvcf文件的时候发现文件里只有双亲的信心，核查发现两个子代的gvcf文件的表头中两个池的名字都是感亲的名字这个怎么修改

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重测序想要我的物种的某些基因序列，可以拿到吗？

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10 同一物种不同基因组（已经组装好）之间可以call snp么

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重测序课程中批量设计引物，脚本问题

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我买了基因组重测序方面的课程，其中课上的老师是在win10 状态下把目录建在D盘上，但是在Linux系统上我也把目录建立在D盘上显示错误，这个怎么样解决呢，方便解答下？

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测序公司发来的是组装好的测序结果，其中里面有全基因组的序列（fa格式），这用组数据可否进行“基因组重测序分析”课程中讲的snp，indel，sv等分析呢？

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麻烦老师问一下，在做重测序的时候这个地方老是出错是怎么回事，路径都仔细检查过了，谢谢老师。no such file

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QTL-seq分析问题

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麻烦老师问一下，在做fastaC时，出现这种是怎么回事?

  • 2020-07-31 09:50
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老师你们好，想问一下如何在自己服务器上下载docker

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5 怎么利用BSA测序的数据的双亲和子代池的重测序数据设计KASP标记，有没有这方面的脚本可供学习,或者课程

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黄老师，怎么利用BSA测序的数据的双亲和子代池的重测序数据设计KASP标记，有没有这方面的脚本可供学习

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如何将基因组序列里的简并碱基变成N或者保留其中一种?

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黄老师，我已获得BSA流程过滤后的snp的vcf文件，然后怎么利用这个文件绘制全部染色体的SNP-index的曼哈顿图

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我在用snpeff进行snp注释的时候，发现出现如下错误java.lang.RuntimeException: Error reading file '/home

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15 GATK中call SNP出来的SNP里面的ALT列出现 * 星号啥意思？

  • 2020-02-25 11:05
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15 GATK 建立压缩的VCF文件索引报错 IndexFeatureFile

  • 2020-02-24 16:52
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你好，腾讯云服务器里面的学生购买的的那个，可以用来进行重测序数据的比对以及SNPcalling等的数据分析吗

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SNPcalling的方式有samtools结合bcftools，或者bcftools，或者gatk，三者之间有什么区别，那种方式更好一些

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我在利用GATK进行SNPcalling前对bam文件进行Markduplication时，运行命令后，并没有生成去除重复reads后的bam文件，请问是什么原因？