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老师你好，我在进行到基因结构分析structure这一步时，出现错误 望解答，感谢！

  • 2025-04-03 18:04
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单细胞测序数据两个子集合并

  • Zzz 2025-04-27 17:18
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根据没有标识转录本是1还是2或3的IDlist基因号名单，在标识了转录本的蛋白质序列文件中搜索，可以把IDlist名单中的所有转录本蛋白序列搜索出来吗？可以改命令达成？这是我的命令seqkit grep -f Nramp_IDlist_final.txt arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.protein.faa -o Nramp_pep_final.fa 我把IDlist里面名单后面都加了转录本号才搜出来。？

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GATK 很慢，怎样分染色体CALL 变异

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10 群体遗传分析中iqtree构建系统进化树出现警告和错误

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使用monocle3进行轨迹分析报错

  • Zzz 2025-04-27 16:56
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使用单细胞转录组课程中的代码进行GSVA分析时，找不到所关注的通？

  • Zzz 2025-04-26 16:19
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单细胞测序FindAllmarkers

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GWAS分析的教程中06.impute的beagle填充出现问题

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单细胞测序的细胞通讯分析 cellchat

  • Zzz 2025-04-28 16:55
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代谢组富集分析时文档07.all_keggid.txt里是某个模式物种的全部代谢物还是公司检测出的所有代谢物？还有富集分析一般p值就可以吗

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10 在国家基因组下载的基因组信息是这样，请问下面这一步该怎么修改

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itol里面的控制面板control panel 找不到了

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5 单细胞测序进行拟时分析绘制细胞骨架图

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36 泛基因家族分析之Fam_gene.list

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单细胞测序使用subset脚本提出子集，再进行拟时分析报错plot_genes_by_group

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GWAS分析发现的问题如下：第一，过滤水稻vcf的RawData时（群体有176份），我选择的minGQ值为20（同时要移除InDel），结果得出过滤出来的SNPs数量不足1000，但是我查过一些资料，GQ值如果群体数量较少值不得小于20。请问遇到这种情况如何处理，可否将最小GQ按照课程的脚本设置为0呢。 第二，你们的GWAS课程提供的计算BLUP的脚本是否在不同物种之间通用 第三，做GWAS时，基因型填充对后续的分析有什么意义。 第四，你们GWAS课程有没有计算遗传力相关的脚本。

  • John 2025-03-12 15:37
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老师您好，针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/7725。你们提到：你这个数据里面是不是P值有0的情况，取了对数就无穷大了，导致出问题。但是，我发现里面没有P值为0的情况，那是不是脚本gwas_manhattan_plot.r有问题呢？需要修改gwas_manhattan_plot.r脚本的什么地方才可以解决顶部只能画半圆的问题呢？还有，我发现P-Value的原始文件有NaN的情况，是什么原因呢？是否对GWAS有影响呢？

  • John 2025-03-18 15:15
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请问个人怎么才能下载到TCGA的组学，临床和WSI影像数据？

  • Sasa 2025-07-01 10:16
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10 求助，有没有用过smudgeplot做过倍性分析的大佬，对psmudgeplot.py plot参数有疑惑，请问应该然后解决，感谢