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单细胞高级分析代码的报错求助

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10 群体遗传分析中iqtree构建系统进化树出现警告和错误

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老师您好，使用beagle 进行基因型填充的时候填充依据是什么啊，是后台有参考数据库吗？

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5 could not find function "newCountDataSet"运行deseq_analysis.r这个脚本报错

  • 荣 2024-12-12 16:45
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基因家族两个结构域

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hifi组装和ont组装n50小了十倍正常吗？

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想请教一下，我是基于windows+docker做的宏基因组注释，然后在去宿主这一步，卡住了 不知道为啥 一直不动

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参考基因组这个docker怎么练到filezilla，为什么我没法安装openssh或者filezilla，我应该怎么做

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hmmsearch 关于参数--cut_tc设置

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基因家族一个基因的两个结构域序列重叠

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泛基因家族分析cds提取出现killed

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老师，我想知道我在用你们演示的玉米数据提取cds和pep的脚本为什么都运行不对，第一个我是用了你们给的TransDecoder下载地址。第二张图用5.7版本的自己的数据是输出空文件

  • aa1 2025-01-08 19:57
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搜集的gff3文件；第一列不同，有的是chr，有的是id；这个影响吗？

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根据覆盖度及比对率如何剔除样品、gatk VariantFiltration过滤

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用ALLHIC挂载出现报错

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ls ../data/*.fa. |sed -e "s/.fa.//g" -e "s#../data/##g" > ../id.txt执行这条命令的时候，未能得到id.txt文件；2.想问一下：每次关掉putty的时候，都需要重新dockers run进入吗？3.软连接之后发现01.data prepare里面有玉米的数据了如何删除此01.data prepare？4.现在发现需要上传id.txt文件，将11个样本名输到txt文件里面，通过filezilla上传到data，再进行docker run？

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20 请教一下TCGA的蛋白数据怎么理解，它是有正负值的，这个正负值代表什么意思，为什么蛋白表达会有负值？我只想给它分成高表达，低表达和表达缺失组应该怎么处理呀？

1 解决

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  • 2024-12-31 12:09
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泛基因，SV ，VCF文件格式为4.2 ，没有课程里要求的SUPP_VEC和SVLEN信息，怎么改？会影响后面分析吧？

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重测序