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lefse分析细节

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eggNOG 保留蛋白序列时提示同一 ID 被多个一级特征使用，而子特征的 Parent 属性没有得到相应更新，导致注释关系不明确的问题，该怎么解决

1 解决

Hic挂载时 K值选择

  • _He. 2025-04-23 08:48
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10 老师您好，我在运行megahit对200多个环境微生物宏基因组数据进行组装时，megahit报错Exit code -9

  • Zz1 2025-05-27 11:03
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我在win11本地GWAS分析时，进行plink。结果报错了（Segmentation fault （Core dumped）），请问各位如何解决

  • John 2025-03-12 15:36
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5 juicer 报错： Failure during chimera handling of

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进不去docker，镜像，虚拟机。

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想咨询一下老师，这个图大概是咋做出来的，应该用到什么样格式的数据，在网上没搜到教程，主要是需要什么数据，谢谢老师

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单细胞测序，想要以选定的基因绘制2.2这样的图，应该怎么做

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5 叶绿体基因组组装过滤代码错误

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用GATK call 变异的时候，分染色体还是很慢，能不能增加线程或别的改进的方法。

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如何合并两个单细胞测序中的两个子集？

  • Zzz 2025-04-26 22:41
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全基因组关联分析GWAS教程中的beagle填充问题

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5 docker load -i /mnt/data/home/liangziyang/metagenomics-data/metagenomics-v1.2.tar.gz加载docker时提示no space left on device

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对宏基因组数据进行αβ多样性分析时，进行抽平处理是不是会更好，然后进行微生物组成功能的差异分析时，需要做抽平处理后再求相对丰度吗

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5 老师您好，我在运行megahit对200多个环境微生物宏基因组数据进行组装时，megahit报错Exit code -9

  • Zz1 2025-05-27 10:13
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关于填充gap后的polish

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linux 下 R 命令怎么后台运行

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5 mummer比对syri进行SV检测报错

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采用你们课程的：Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以及Rscript $scriptdir/qq_plot.r制作Manhattan图和QQ图后，Manhattan图最高的SNP仅仅显示半圆（如下图），请问如何修复（就是修改可视化Manhattan图的纵坐标）

  • John 2025-03-12 15:35