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请教一下TCGA的蛋白数据怎么理解,它是有正负值的,这个正负值代表什么意思,为什么蛋白表达会有负值?我只想给它分成高表达,低表达和表达缺失组应该怎么处理呀?
TCGA
卡西莫多
2024-12-09 11:01:00
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TCGA下载 docker报错
TCGA
失败算什么
2022-06-28 11:35:31
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TCGA差异分析如何根据临床信息分组?
TCGA
heiwei
2022-03-21 23:08:50
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TCGA用R数据下载错误
TCGA
答案tan90°
2021-11-09 09:48:39
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老师,想请教一下TCGA基因表达数据的问题,我从xena.ucsc网页上下载了基因表达数据TCGA-CESC.htseq_counts.tsv;然后发现该数据中只有Ensembl格式的基因ID ,没有SYMBOL格式的。所以接下来进行基因ID格式转换,却发现同一个SYMBOL ID对应的多个Ensembl格式的ID,想问下老师,这种情况该怎么处理?同一个SYMBOL ID所对应的多个Ensembl格式ID的基因表达数据应该留下哪一个?
生存分析
TCGA
基因表达数据下载
Bella
2021-10-25 16:15:08
0
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3391
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TCGA的RNA-seq count annotation过滤,有些不知道是否需要删除
TCGA
样本过滤
一个正常的ID
2021-10-19 23:32:29
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回答
7825
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代码报错
TCGA
冯鳗鱼
2021-09-24 21:02:25
1
回答
2981
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tcga_gene_exp_download.r 运行后只得到临床数据,为啥的不到基因表达的counts,tpm,fpkm
TCGA
Gre
2021-08-31 17:17:04
1
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2712
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tcga_gene_exp_download.r -p TCGA-STAD -m 下载tcga数据,过程中进程多次在同一个地方被killed
TCGA
Lei
2021-08-30 00:41:41
2
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3582
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老师好,R包一直安装失败不知道怎么回事,Bioconductor上的安装出现问题,如图所示(但是加载的话不报错!),还有就是VIP还是没通过呀,我子订单也提交了
TCGA
TCGAbiolinks
齐鹏举
2021-07-09 08:59:44
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回答
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在TCGA构建ceRNA网络,数据用代码下载不完全啊
ceRNA
TCGA
YYL
2021-03-11 20:19:44
1
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3501
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电脑内存不能升级,运行Rstudio内存一直上升,请问还有其他方法解决这个问题吗。
TCGA
可乐
2020-10-31 09:33:21
1
回答
3348
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gdcRNADownload(project.id = 'TCGA-CHOL', + data.type = 'RNAseq', + write.manifest = FALSE, + method = 'gdc-client', + directory = rnadir)
TCGA
TCGAbiolinks
逐影
2020-10-30 20:40:58
1
回答
4501
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为什么在使用TCGAbiolinks包下载数据时会出现以下问题呢?
R
TCGA
TCGAbiolinks
Ananas
2020-08-28 17:07:08
1
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4031
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R4.0.2版本没有read_delim函数,怎么读取临床数据?
R
TCGA
杨娃娃
2020-07-30 22:48:52
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