omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
15199金币数
85570 经验值
459个粉丝
主页被访问 100312 次

最近动态

1天前 发表了文章

2天前 发表了文章

2026-07-30 18:14 发表了文章

2026-07-28 14:59 回答问题

 --gene2pathway ../ref/kegg.gene2pathway1.tsv \   --gene2go ../ref/go.go_anno_result1.tsv你的上面这两个文件,看看文件格式是不是和课程里面的相同,并检查第一列信息的基因ID和你的单细胞里面的feature ID是不是一致:

2026-07-21 11:50 发表了文章

2026-06-29 10:01 回答问题

你检查你  SampleID 列 和  seurat_clusters 列是不是有的分组数量太少,比如你的SampleID 列在第4列:设置 $4 awk -F'\t' 'NR>1 {print $4}' benihoppe_flower_sct.metadata.tsv | sort | uniq -c

2026-06-26 16:45 发表了文章

2026-06-25 16:31 回答问题

查看你benihoppe_flower_sct.qs  对应的benihoppe_flower_sct.metadata.tsv 文件有没有 “Sample”列信息

2026-06-24 14:16 回答问题

课程资料已经更新了 ;重新下载一下

2026-06-14 08:59 回答问题

华大DNB C4 单细胞转录组也有类似 cellranger的工具: dnbc4tools ,用法差不多,结果文件也类似的: dnbc4tools rna run \--name 1D1 \    --cDNAfastq1 ~/BGI-sc/data/ara/DP8400025960BR_L01_97_1.fq.gz \    --cDNAfastq2 ~/BGI-sc/data/ara/DP8400025960BR_L01_97_2.fq.gz \    --oligofastq1 ~/BGI-sc/d