15小时前 回答问题

超过500M的染色体，GATK 索引不支持； 1.解压g.vcf.gz  2. 解压后的vcf文件建立索引： gatk --java-options "-Xmx50g"  IndexFeatureFile -I  demo.g.vcf3.用解压后的g.vcf导入数据库

16小时前 回答问题

The problem is in the zipped (g.vcf.gz) files, for big genomes (chromosomes with size of > 500 mbp), the tbi index format can handle chromosomes up to ~ 530 Mbp. Indexing with csi is the option for large genomes with large chromosomes, but unfortunately

20小时前 回答问题

docker hub 国内上不了了，如果购买我们课程可以 ： 联系客服处理：点击联系客服

1天前 回答问题

你这个信息截图不全，没发现有什么异常的报错； 最后的信息也是warn警告信息，不影响结果的； 看一下服务器内存是多少，内存不够运行样本太多也会报错； free -h #查看内存

1天前 回答问题

看看服务器内存多少，内存不够也可能出现这个问题： free -h #查看内存

1天前 回答问题

看GC分布图没问题，前面几个碱基抖动正常的；

1天前 回答问题

购买了我们课程请使用docker镜像分析；镜像里面安装了课程里面的软件； 

1天前 回答问题

是的，你的是什么物种就下载对应的物种基因组；然后建立索引

1天前 回答问题

生成的文件已经存在，你重新运行删除一下这个文件

5天前 回答问题

这里有例子你看看的：https://www.omicsclass.com/article/2483 更多例子：https://www.omicsclass.com/article/2482