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21小时前 回答问题
dockerhub 国内上不了，有购买我们课程可以联系客服处理：点击联系客服
21小时前 回答问题
docker 加载镜像默认放在家目录下，你的家目录满了吧； df -h #查看存储
1天前 回答问题
命令写错了，perl 后面根perl脚本，你后面根vcf文件，不对的；
1天前 回答问题
看看这个问题：https://www.omicsclass.com/question/7704 cellchat的bug，你用数字代替细胞分组
1天前 回答问题
试试加 -f参数试试； rm -rf shells 更改所有者： chown -R us019:us019 shells
2天前 回答问题
你的轨迹可能只有一个，导致报错，打开那个R脚本这里修改一下：
2天前 回答问题
下面是手动修改列名的R代码，你自己可以运行修改一下： # 加载必要的包library(Seurat)library(dplyr)## 1. 创建示例Seurat对象（如果已有数据可跳过此步）# 使用Seurat内置数据集seurat_obj <- readRDS("subsetCD8.reanalysis.rds")# 查看原始metadata列名cat("原始metadata列名:\n")print(colnames(seurat_obj@meta.data))## 2. 修改metadata列名
2天前 回答问题
内置的 基因集数据库用的R包是这个：msigdbr 说明：https://igordot.github.io/msigdbr/articles/msigdbr-intro.html 常见的分组： gs_catgs_subcatnum_genesetsC1 299 C2CGP3384 C2CP29 C2CP:BIOCARTA292 C2CP:KEGG186 C2CP:PID196 C2CP:REACTOME1615 C2CP:WIKIPATHWAYS664 C3MIR:MIRDB23
2天前 回答问题
还是用之前的脚本合并：示例脚本在： 03.seurat_cluster.sh #合并数据Rscript $scripts/merge_seurat_obj.r -i CD4.added.celltype.rds CD8.added.celltype.rds -p all.sample.merged
6天前 回答问题
前面有个 export 开头的行命令执行一下；