2天前 回答问题
华大DNB C4 单细胞转录组也有类似 cellranger的工具: dnbc4tools ,用法差不多,结果文件也类似的: dnbc4tools rna run \--name 1D1 \ --cDNAfastq1 ~/BGI-sc/data/ara/DP8400025960BR_L01_97_1.fq.gz \ --cDNAfastq2 ~/BGI-sc/data/ara/DP8400025960BR_L01_97_2.fq.gz \ --oligofastq1 ~/BGI-sc/d
3天前 回答问题
1. 把作物的所有基因与拟南芥比对,借此寻找细胞周期相关基因,是否合理? 结论:这是非常合理且常规的做法,但建议在此基础上增加一些过滤和验证步骤。 合理性: 拟南芥(Arabidopsis thaliana)是植物界功能注释最完善、研究最深入的模式生物。对于缺乏深度研究基础的非模式作物,利用拟南芥作为参考数据库(Reference)来挖掘同源基因是标准的生物信息学流程。优化建议:避免简单的 BLAST 假阳性: 简单的 BLAST(如 BLASTp)可能会因为蛋白结构域的保守性(例如所有的蛋白激酶都有激
6天前 发表了文章
2026-06-09 18:36 回答问题
qs文件应该是 seurat 对象,不是一个表格文件;生成的命令发我看一下; 批次分组名称需要和你qs对应的metadata文件里面的列名一致,我看你tsv文件里面没有stim列名分组:
2026-06-01 16:57 回答问题
功能区域/类型解读 这一列直接告诉你变异的分子后果,可细分为几大类,我整理成另一个表格方便你查询: 类别常见取值含义与影响外显子区 (编码)nonsynonymous SNV非同义突变:单个碱基改变导致氨基酸改变(错义突变)。synonymous SNV同义突变:碱基改变但氨基酸未改变。stopgain获得终止密码子:突变导致提前出现终止信号,产生截短蛋白。stoploss失去终止密码子:终止密码子突变,蛋白翻译会延长。frameshift insertion/deletion移码突变:插入/缺失的
2026-05-25 09:34 回答问题
正常的,耐心等待,数据越多越慢;
2026-05-18 14:21 发表了文章
2026-05-15 13:06 发表了文章
2026-05-14 07:33 发表了文章
2026-05-13 21:41 发表了文章