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LD分析相关问题

  • John 2026-08-31 15:47
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LD结果原始数据如何看

  • John 2026-08-29 12:48
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老师，我用perl $scriptdir/vcf2hmp.pl clean.vcf.gz hapmap.txt.gz这个之后用gapit的那些模型分析时总是报错

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老师，我用perl $scriptdir/vcf2hmp.pl clean.vcf.gz hapmap.txt.gz这个之后用gapit的那些模型分析时总是报错

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老师，我做的是人的连续型变量，图片为什么会这样呢，可能是什么原因啊

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无法找到和下载docker pull omicsclass/pop-evol-gwas:v1.2镜像

  • 2026-05-09 00:00
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有没有GWAS做之前的表型数据一致性分析教程

  • WYS 2026-04-10 10:05
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GWAS获得显著位点如何去设计分子标记？

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随着PCA数目的增多，GWAS峰值越来越高，显著位点越来越少

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在用GEMMA软件进行GWAS分析的时候，需要加入Q矩阵，有一个疑问

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EMMAX进行GWAS分析时候出现问题

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分别用FarmCPU和BLINK做GWAS，从Q-Q图看BLINK模型更优，但是FarmCPU曼哈顿图有峰

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Tassel表型文件和基因组文件样本量不一样

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请问我在做性状绘图时出现报错，我的数据格式应如何修改

  • Max 2025-09-15 11:23
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请问我在做GWAS性状绘图时出现以下报错，我的数据格式该怎样修改，该如何解决？

  • Max 2025-09-15 11:20
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GWAS分析的表型数据不符合正态分布，但是极值材料表型是真实存在的，所以是保留原始数据还是用IRNT转换表型值或者剔除不符合正态分布的值呢

  • 2025-07-11 23:22
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我用gemma做小麦的gwas分析，到最后一步生成曼哈顿图时出错，是因为参考基因组的染色体编号与基因型数据对应不上吗，应该怎么老师解答

  • 2025-07-10 03:28
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老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？

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LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \ -Region scaffoldC01:46993000-46994000 -OutPng -SeleVar 2 -InGWAS ld.pvalue.txt这条代码如何修改能使中间的字体大一点

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tassel导入表型数据和Q文件，一直报错格式有误