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3天前 回答问题

内存有300G， 这个参数（nucmer --maxmatch -g 1000 -c 90 -l 40 -t 5 -p $query ref.fa  $query.fa）该怎么设可以不超过内存？-t 10 改成了-t 5， 其他还需要改吗？改成-t 5 。 我的基因组有12个个体，每个个体大约有2.5G，怎么设置这个大小？

5天前 发起提问

6天前 发起提问

2026-10-10 16:19 发起提问

2026-10-08 10:10 回答问题

运行之后出现这些错误，怎么回事？

2026-10-07 12:30 发起提问

2026-10-02 08:46 发起提问

2026-10-01 08:28 回答问题

内存有300G 还不够吗？如果我去掉--maxmatch 参数就可以运行，nucmer  -g 1000 -c 90 -l 40 -t 10 -p $query ref.fa  $query.fa，不知道这样有没有影响？怎么样可以减少内存使用，需要-t 10 参数改小点吗？

2026-09-28 22:11 发起提问