python版mcscan

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老师，在泛基因集构建时JCVI的比对，出现以下错误

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绘制不同物种间共线性图报错

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老师，我在做不同物种共线性分析的时候，配置文件的过程中出现如下错误，刚开始是按照视频教学的复制文件过来用，后来报了这个错，就从头配置白菜基因组文件，但是还是报一样的错，想问问怎么解决？

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物种间共线性分析报错

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多物种共线性分析问题，应该怎么解决

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多物种共线性分析最后一步报错

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基因家族物种间共线性，老师，为什么我的物种间共线性分析总是报错，我检查了文件格式他还是报错。 我用这个物种的文件vs这个物种的文件就可以得到结果，两个不同的就没有结果，文件应该没有问题。这是为什么呀老师？（下面的图片也是同一个物种，但是不是同一个网站的数据）

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比较基因组学 关于绘制3个以上的物种基因家族进化与同源关系(mcscan python版本)

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基因家族 共线性分析 运行报错

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MCScanX

  • leung 2022-03-17 21:07:24
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请问，首次使用MCscan (Python version)可视化作图时，没有mcscan_seqids和mcscan_layout文件，该怎么创建这两个配置文件呢？自己创建的配置文件运行后，结果文件有问题

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老师，你好，我在学视频做两个物种间的共线性分析时结果出现的是这种。帮忙看看什么原因，谢谢。

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python 版本的mcscan 绘图输出报错， need more than 0 values to unpack

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老师好！我使用JCVI按照官网流程处理两个物种，每次都提示ValueError: A total of 0 anchor was found. Aborted.麻烦您帮我看看，谢谢！

  • aaaaa 2021-07-05 22:43:20
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输入脚本后报错，python mcscan jcvi 共线性分析报错:ValueError: invalid literal for int() with base 10: ''

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