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利用代码绘制共表达网络时，有一个聚类最多的基因颜色模块没有导入Cytoscape的两个文件，谢谢老师

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我想咨询一下wgcna问题

  • Iok 2023-06-30 15:52
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5 样品聚类树图片不显示

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5 运行WGCNA代码时出现下图报错，下载packageGO.db显示版本不对，是不支持最新版本吗。这一步不解决无法进行下面所有操作，请问老师如何解决

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3 同一个基因出现在WGCNA的不同模块里，red和blue里，哪里错了，请指教

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10 GSE13015提供的标准化后的表达值有负值，能否直接用来做WGCNA分析，还是要做其他预处理？ 请各位老师帮忙解答下，感激不尽！

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老师您好，我在做WGCNA分析时，无法打开'9.Module_membership文件，相关报错截屏和操作文件已发布，请问老师，是哪一步出了问题？该如何解决？谢谢老师。

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WGCNAcor相关系数的选择

  • 2022-07-07 18:15
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参考图片

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WGCNA TOM可视化报错

  • 2022-04-06 13:13
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做WGCNA分析，性状数据可以同时有数量数据和分类数据吗？

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请问老师我做WGCNA这一步TOM = TOMsimilarity(adjacency);卡主不动。

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5 安装WGCNA编辑包出现如下问题怎么解决？

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10 WGCNA如何只提取某一模块到Cytoscape中来绘制网络？

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老师你好我在做WGCNA分析时，将癌症样本定义为1，癌旁样本定义为0，同样的代码都是把表型文件以及表达文件以CSV格式输入但是，用另外一组数据出来的结果得到的是性状与模块相关性热图上P值和相关性值全是NA

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10 WGCNA中想做一个样本——模块热图，求指教

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5 老师您好，WGCNA power值很奇怪，感谢您的回答！！

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你好，想问一下在用wgcna分析时，导入后显示不允许有重复的row.names，请问这个问题怎么解决

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老师您好想想您请教一下这个wgcna中临床表型如何转换为数字性状数据呢，不知该如何定义

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WGCNA分析，导出cytoscape的.nodes文件 但是打开txt文档里面的内容是空白的，代码中参数有基因的名字，恳请各位大佬帮忙解决问题。