bcftools创建vcf索引失败

bcftools创建vcf索引失败

遗传图谱中各种作图群体介绍

基因定位在动植物研究中非常重要,利用遗传图谱很多科学家定位了重要作物的重要农艺性状,例如克隆水稻分蘖基因 MOC1 的李家洋院士团队,克隆了水稻粒重基因 GW2 的林鸿宣院士团队……,还有数以...

GFF或GTF格式转bed

GFF或GTF格式转bed

不同物种基因组之间的比对与可视化

基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较,以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...

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  • Ti Amo
  • 发布于 5天前
  • 阅读 ( 32 )

不同物种基因组之间的比对与可视化

基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较,以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...

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  • Ti Amo
  • 发布于 5天前
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Linux重定向以及nohup不输出的方法

在Linux中,0、1和2分别代表标准输入(stdin)、标准输出(stdout)和标准错误输出(stderr)

使用bcftools文件提取vcf文件子集

1. 准备好要提取的染色体及位置信息文件id.list。文件示例如下: Chr1    11787600        11793521Chr1    30028805        30042382Chr1    54966087        54970283Chr1    57228272     ...

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  • rzx
  • 发布于 2024-03-11 18:13
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qiime自带的alpha_diversity.py脚本报错

alpha_diversity.py -i some.biom -m observed_species,shannon,chao1,simpson,ace,goods_coverage 在运行时报错 File "/share/work/biosoft/python/Python-v2.7.11/lib/python2.7/site-p...

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  • xun
  • 发布于 2024-03-11 09:43
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TukeyHSD报错

Error in TukeyHSD.aov(., ...) : no factors in the fitted model Calls: %>% ... is.data.frame -> <Anonymous> -> TukeyHSD -> TukeyHSD.aov In addition: Warning mess...

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  • xun
  • 发布于 2024-03-08 10:16
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HISAT2比对时报错|(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL)

我有12个样本在进行HISAT2比对时有3个样本出现报错(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL) 运行脚本: hisat2 -p 10 --rg-id=L2 --rg SM:L2 --rg LB:L2 --rg PL:ILLUMINA -x iwgsc_re...

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  • rzx
  • 发布于 2024-03-07 10:12
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紧扣国自然热点--7大研究培训总有你需要的!

新的一年已经开始,正所谓春耕秋收,春天正是积累的季节,对科研人员来说选对学习的方向才能收获丰硕的成果。后基因组时代,生物科研圈最大的矛盾是:与日俱增的数据量和科研人员处理数据的能力...

R语言“had non-zero exit status”安装报错

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  • 星莓
  • 发布于 2024-03-05 10:53
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遗传图谱构建基础知识

遗传图谱构建基础知识

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-03-04 14:48
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MAFFT介绍

MAFFT简介 MAFFT是一种流行的多序列比对软件,广泛应用于生物信息学领域,特别是在系统发育分析和功能基因组学研究中。它通过采用快速傅里叶变换(FFT)来提高比对的速度和准确性,适用于大规...

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  • xun
  • 发布于 2024-03-04 13:43
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bcftools建索引报错:Chromosome blocks not continuous

bcftools建索引时报错“染色体区段不连续”

GO富集分析统计表中差异基因数量不一致

GO富集分析统计表中差异基因数量不一致

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  • 安生水
  • 发布于 2024-03-04 11:29
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绘制venn图报错Unexpected parameter length for "category"

在进行韦恩图绘制的时候出现报错: 出现这个报错的原因是在输入数据应当是一个有名字的list,要求是这个list中的每个元素都有名字。 venn <- list(A,B,C)names(venn) <- c("A","B",...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-03-01 17:25
  • 阅读 ( 82 )

笔记本电脑本地连接以太网时如何手动设置IP?

一般情况下,我们笔记本在使用网线连接上网的时候,路由器会自动给你分配一个内网IP。这个IP也是不固定的。 有时候我们会突然遇到连接断网的情况。在排除硬件坏掉情况下,最大原因是自动分配的...

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  • rzx
  • 发布于 2024-02-26 18:01
  • 阅读 ( 224 )

R语言ggplot2散点图添加拟合曲线和回归方程

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  • 星莓
  • 发布于 2024-02-23 17:10
  • 阅读 ( 146 )

使用fastp软件对fastq文件进行剪切

使用fastp软件对fastq文件进行剪切

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  • 安生水
  • 发布于 2024-02-22 17:33
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