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孟德尔随机化(MR)

前面的文章中我们给大家介绍过eQTL和sQTL的概念, 大体总结一下，eQTL是指基因组上的一些突变可以改变相关基因的表达，sQTL是指这些突变同时也会导致可变剪接的差异,实际上这两个都是归于一个叫...

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  • 发布于 1天前
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宏基因组的基因组binning-BASALT 介绍和用法

宏基因组的基因组binning（分箱，即将测序数据中的reads或contigs分类到不同的基因组中）是一个关键步骤, 常用的软件是2018发表的metawrap,但是他一直没有更新, 这篇文章将介绍一个较新的binnin...

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  • 发布于 1天前
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LeafCutter可变剪切注释

目前主流的探究转录组数据的可变剪切的算法是基于estimate isoform ratios 或者 exon inclusion levels ,但是可变剪切本跟正常转录本重合的比例很大，存在技术误差也，且他依赖于基因现有的注释...

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  • 发布于 1天前
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命令并行思路

大多数人在服务器上运行命令的时候,爱使用循环或者逐条运行,这其实无法发挥服务器的性能,在不用花的时间上浪费了很多时间,本期我们来从简入难,汇总一下服务器并行的思路 01 — 基础并行,不...

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  • 发布于 1天前
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多组学联合分析—桑基图

多组学联合分析—桑基图

一文教你绘制GO富集分析弦图，简单又好看

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IF=4.8|对4种天南星科植物基因组进行WRKY基因家族分析，并分析其在魔芋中的表达

“ 2025年12月 Frontiers in plant science杂志发表了一篇题为“Genome-wide characterization of WRKY family genes in four araceae species and their expression analysis in Amorphophallu...

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  • rzx
  • 发布于 1天前
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选择清除分析之XP-EHH

在群体遗传学中，选择清除、连锁不平衡和单倍型是三个紧密关联的核心概念，它们共同帮助我们理解自然选择如何在基因组上留下印记。今天先来说说选择清除分析。 一、 核心概念解析 选择清除：...

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  • Ti Amo
  • 发布于 3天前
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STAR构建基因组索引报错

报错提示： Fatal LIMIT error: the number of junctions to be inserted on the fly =1412348 is larger than the limitSjdbInsertNsj=1000000Fatal LIMIT error: the number of junctions to...

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  • rzx
  • 发布于 2025-12-30 09:22
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bam文件出现负坐标

不管是重测序或者是有参转录组，很重要的一环就是将测序数据比对到参考基因组上。一般来说，常用比对软件都可以正常运行结束，但是当碰到超大基因组的时候难免会碰到一些问题，这些问题有的时候...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-12-18 15:27
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带推断线的进化树

在一些群体遗传进化的文章中，会展示整合了物种分类和大量系统发育推断（灰色虚线）的进化树，接下来小编将绘图代码贴在下面，效果如下图： 1.准备数据 准备3个文件，其中两个nwk格式的树文件...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-12-18 14:49
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空间转录组细胞分割

https://www.bilibili.com/video/BV1Ct421H7ST/?spm_id_from=333.337.search-card.all.click&vd_source=6cc688872dbaeabe125ff35d0ca9e710

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  • 发布于 2025-12-17 18:16
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GATK SPARK 环境安装 加速GATK

GATK SPARK 环境安装

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  • 发布于 2025-12-11 15:22
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SCP 安装成功的单细胞转录组 docker镜像使用 single-cell-v5

SCP

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  • 发布于 2025-12-05 20:00
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组学助手--组学大讲堂官方助手

如果您有关于组学大讲堂培训、云服务器相关的售后问题，或者需要进行续费操作，请扫描下方二维码联系我们。

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  • omics007
  • 发布于 2025-11-24 14:22
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USB挂载到KVM虚拟机

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-11-23 13:11
  • 阅读 ( 285 )

修改单细胞转录组分组

修改单细胞转录组分组

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-11-13 09:58
  • 阅读 ( 703 )

人免疫细胞marker基因

人免疫细胞marker基因

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  • 发布于 2025-11-06 14:24
  • 阅读 ( 1424 )

monocle2 monocle2 igraph 报错

monocle2 igraph 报错

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  • 发布于 2025-11-04 18:19
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IF=29|苔藓植物的超泛基因组分析

“ 苔藓植物全世界约有22000种。迄今为止，55个苔藓植物目中只有8个进行了基因组测序，为了进一步了解陆生植物基因组进化过程，这篇文章测序、组装并注释了123个高质量且高度完整的苔藓植物基因...

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  • rzx
  • 发布于 2025-11-03 09:39
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