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老师你好，请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量我有几个不同浓度胁迫下的转录组数据，想利用此数据分析一下某基因家族，请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量?依据表达量画差异表达图？

  • 2天前
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5 老师，你好，我在学视频做两个物种间的共线性分析时结果出现的是这种。帮忙看看什么原因，谢谢。

  • 3天前
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python 版本的mcscan 绘图输出报错， need more than 0 values to unpack

  • 2021-09-18 12:57
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E-value值筛选

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CIRCOS共线性作图

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Hyper-V 不能全部打开 win10家庭版 docker 安装不成功

  • MNY 2021-08-31 16:57
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老师，请问做共线性图只得到半圆，是什么原因？谢谢！

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对于已经公布基因组的物种，如何制备染色体水平的GFF3文件？因为平台上不公布。

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基因重叠问题

  • 2021-08-25 21:10
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ka k s 分析过程中遇到两个序列不相等，结果文件为空，安装老师那篇回答里面检查并修改，运行命令后出现下面的结果，命令被杀死了killed

  • 2021-08-24 20:04
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基因家族成员命名问题

  • 2021-08-24 11:34
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老师好，这是我在绘制圈图时出现的一半有数据，一半没有数据，反复检查文件之后，并未发现问题的地方，麻烦老师看一下

2 解决

老师，我想问一下为什么我的共线性分析的圈图一半有数据，一半没有呢 circos

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老师，我在提取gene_exon_info.gff文件提取时运行正常，但是提取的结果不完整是为什么？有200多个基因但只提取出来几十个基因的信息

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老师，我从文献查找到了基因ID，类型是这样的：LOC_Os01gll200.1，然后到“Myb_DNA-bind_4_domain.fa”文件中去查询，而domain的ID类型是这样的，我该怎么做才能对应起来？

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5 鉴定同源基因的orthoMCL和OrthoFinder在结果上有什么区别嘛？谢谢各位老师啦~

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老师，这是我在做共线性分析最后一步出来的结果，但我看不懂，麻烦您解答一下

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MEGA构树NJ法出现的问题

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老师你好，在家族分析中，用tiquxulie.pl脚本提取序列时，总是报错，看了前面他们做的，我拆成每条染色体进行提取，但还是不行

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mcscanx