4天前 回答问题

gff3格式不合规，他要求是

2025-06-06 11:56 回答问题

1. jellyfish histo这一步的 -h 参数也需要同步调大。 2. 较短的k-mer（如k=21）在重复序列中易产生交叉比对，导致重复序列被低估，可以多测试几个k值。

2025-06-04 13:23 回答问题

minimap2跑不过去，可能数据太大了爆内存了，可以考虑命令里面加参数--minmap_arg '-f 0.1'，-f的意思是通过移除高频出现的重复性 minimizer，来减少重复序列对计算过程的干扰

2025-05-30 17:35 发表了文章

2025-05-09 10:08 发表了文章

2025-04-30 13:52 回答问题

To fix this, you'll need to install gawk(sudo apt install gawk) on your system. 

2025-04-30 10:31 发表了文章

2025-04-30 09:42 发表了文章

2025-04-25 09:05 回答问题

设置依据是前面那一步，jellyfish stats -o illu.stat illu，这一步的结果illu.stat里面有个Max_count，-h和-m设置的比这个数字大就可以了。不同样本的差异根据这个统计结果判断。

2025-04-23 15:15 发表了文章