3天前 回答问题

详细需要nextpolish.e。报错为raise Exception(record.msg)，初步判断 1.fa或者fq格式建议检查；2. 内存不足，配置文件中降低线程数。

4天前 发表了文章

5天前 回答问题

看看有没有结果？这个是警告信息，不是报错。一般可能是因为节点标签或注释数据包含非数值，或者是支长度或其他数值映射包含问题。

2025-07-01 11:57 回答问题

具体需要看minimap2的报错，初步推断是内存问题，建议加-f 0.1限制一下： -f FLOAT     filter out top FLOAT fraction of repetitive minimizers [0.0002]

2025-06-30 15:33 发表了文章

2025-06-16 09:08 回答问题

docker rum之前需要docker images查看一下自己有没有 localhost/omicsclass/genome-comparison这个镜像。你如果要load -i 起码当前文件夹下面要有genome-comparison-v1.0.tar.gz这个文件

2025-06-11 16:46 回答问题

gff3格式不合规，他要求是

2025-06-06 11:56 回答问题

1. jellyfish histo这一步的 -h 参数也需要同步调大。 2. 较短的k-mer（如k=21）在重复序列中易产生交叉比对，导致重复序列被低估，可以多测试几个k值。

2025-06-04 13:23 回答问题

minimap2跑不过去，可能数据太大了爆内存了，可以考虑命令里面加参数--minmap_arg '-f 0.1'，-f的意思是通过移除高频出现的重复性 minimizer，来减少重复序列对计算过程的干扰

2025-05-30 17:35 发表了文章