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水稻F2群体株高性状的GWAS分析模型选择GLM还是MLM

• GWAS

• lsh 2023-09-19 10:26:58

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Tassel进行自己的GWAS分析中，自动分析pca时，不生成pca1~3文件

• tassel
• GWAS
• PCA

• 993 2023-09-14 15:41:30

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LD衰减分析

• GWAS

• shidandan 2023-08-28 17:19:06

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tassel新报错，求老师们看一下[Thread-8] ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - Index 0 out of bounds for length 0

• tassel
• GWAS

• kid 2023-08-10 16:18:58

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如何通过GWAS的曼哈顿图结果筛选基因？

• 重测序
• GWAS

• linliw 2023-07-27 16:13:45

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您好，GWAS中的LD衰减分析，需要对用到的VCF文件进行过滤（缺失率，第二等位基因频率等）吗？

• GWAS

• 徐鹏程 2023-07-10 10:42:52

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你好，我想请问一下qq图做出来的这种结果是不是不太好呢，横坐标超过4之后突然就变得很陡峭，这大概是什么原因呢？

• GWAS

• Luck 2022-11-18 16:24:16

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LD为什么突然终止呢？自动就killed

• GWAS

• 管笑啸 2022-11-14 19:57:52

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请问我想用GWAS的自然群体进行KAKS分析，请问有什么具体的操作流程吗？

• GWAS
• 遗传进化
• 驯化

• 王辉 2022-08-25 22:28:45

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BSR-seq 结果中的曼哈顿图怎么看？

• 测序数据质量控制
• 测序技术
• GWAS

• 庞云星 2020-11-04 17:26:10

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想问一下，RNA-seq测序之后，进行snpcalling得到的一些snp位点是杂合的，关联分析时按缺失小于0.2,第二等位基因频率大于0.05过滤后，得到的显著位点正好是杂合位点。想问一下，进行关联分析时，怎么处理的分子数据中的snp杂合位点，是直接当成缺失，还是过滤掉，还是基因型填充，还是直接导入tassel进行关联分析？谢谢各位老师

• GWAS
• tassel

• 孙俊生 2020-07-16 19:37:22

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GWAS分析模型的选择

• GWAS

• 鱼喵喵 2019-11-19 11:28:56

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做完GWAS分析有必要做转录组测序进行关联验证么？

• GWAS
• 转录组

• 生信老顽童 2019-01-11 16:27:25