老师您好,我在做真菌物种的泛基因组组装中有一些问题想要请教一下,我的参考基因组组装质量较差,110多个contig,未组装到染色体水平,然后使用二代数据进行迭代组装,二代重测序数据也无法进行基因组组装。使用metagenome-like方法组装出来然后清除污染序列体积为2.8GB。使用unmap组装出来为4.1GB,有2,622,232个contig,但是使用cd-hit-est进行去除重复contig是一直卡住。使用iteratively assembly方法进行组装时merged.fasta组装到700MB时也卡住了。请问老师2.8GB的泛基因组可以使用吗,后面两种方法有办法解决吗?