重测序

我用命令gatk  --java-options "-Xmx300g" GenotypeGVCFs --tmp-dir $tmpdir -R $REF -O all.raw1.vcf.gz -V gendb://db  去合并gvcf 文件,有284个文件, 现在已经合并2天了 还没有结束,程序没有报错,我想知道时间这么长正常吗?下图是运行的过程。attachments-2026-05-qZa9F9ZP6a13a0c20202f.PNG

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

正常的,耐心等待,数据越多越慢;

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,36 浏览
  • 随风 提出于 17小时前