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染色体定位 单位如何标识？用mapchart如何标识标尺单位。

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kneaddata里的trimmomatic的接头文件是通用的吗

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老师，您好。在转录组学和代谢组学做联合分析时，必须要在同一通路下分析，还是相关通路都能分析，如转录组的植物激素信号转导（ko04075）和代谢组的植物激素合成(ko01070)能联合分析吗

  • Echo 2025-09-01 15:00
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共线性分析，请问layout内容问题在哪里？

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老师您好，在做比较基因组提取CDS、蛋白序列和最长转录本时候，提取出的文件是空的，这是什么原因，请老师解惑

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老师您好，进行比较基因组分析时候，在第一步数据处理，保留编码蛋白基因，及最长转录本时，出现报错，这个对后续分析有影响嘛

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Error correction and assembling warnings: * 0:12:28.935 6768M / 13G WARN General (kmer_coverage_model.cpp : 327) Valley value was estimated improperly, reset to 16

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老师，我研究的植物有人已经构建了泛基因组，用的从头组装比对的方式，我想问一下，如何利用他的数据做我的研究，我可以添加几个自己的物种进去吗，请老师给个研究思路

  • Oho 2025-03-27 10:25
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宏基因组分析老师上课的内容。

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hic挂载时，选用那个内切酶

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老师上课的内容，为什么我的demo里面没有东西？

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使用FUSION进行TWAS分析权重训练问题

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老师，我要做泛基因家族分析中泛基因列表构建，我是不是只需要把data数据的基因组和gff文件链接过去，不用再建文件夹下载了，然后一步步做Rstudio的操作么，我需要下载pangenlist里面的哪些文件到自己的服务器？

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老师，想问一下您，用blastp方法做基因家族成员鉴定时，鉴定到了51个成员，其中有几个成员的蛋白序列相似性大于98%，但是位于不同染色体上，这种是否需要删除多余的，只保留一条就够了？

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ALLHIC1挂载出现问题

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老师，我最后做出来的PAV热图没有同源基因，分析了两个原因。

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tgsgapcloser 如何控制minimap占用的内存

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泛基因家族分析

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老师 就是我在做比较基因分析的时候生成的bed文件是空的 这是什么问题呀

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eggnog_file_process.r好像就是将同一功能下不同基因直接相加