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老师，这一步有啥问题呀？麻烦老师帮忙看看,第二张图是我重新删掉文件然后重来一遍的，还是在提取ID这一步出错了，中间也检查了cds文件和pep文件，文件内容是没问题的，除了生成的txt文档是空白的，其他都没啥问题，然后就卡在id替换那一步，麻烦老师帮忙看看

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SNP分析软件SNPT最小SNP分析结果疑问

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老师 就是Rhododendron_delavayi 和Rhododendron_irroratum这两种植物，我把它的fasta和gff3文件下载，然后做各物种的cds和pep文件提取，文件都能出来，但是就是出来的文件是空的，这个问题要怎么处理啊，麻烦老师帮我看一下，谢谢

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染色体挂载问题

1 解决

使用重测序的var_density.R脚本没有按照染色体正确排序，这个怎么解决？

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老师您好，我用plantcare分析顺式作用元件时，只要一上传文件就报错，上传文本（一条序列）的话能正常出结果，不知道这是什么情况

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cnvpytor 不运行

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deblur生成featrue-table出现错误

1 回答

hmmer搜索结构域

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我已经将env.sh中文件的路径改为我自己的路径了，但是为什么这代码在QIIME2环境中无法运行？麻烦老师解答一下

  • JACK 2024-09-18 09:46
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Fam_genelist中基因个数超出了所有的鉴定的数据

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linux里不能通过 sudo docker pull omicsclass/samtools:latest，显示连接超时

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老师您好，请问使用fastp后没有得到每个样本对应的html文件，只生成了一个是怎么回事？

  • BJFU 2024-07-15 16:46
1 解决

老师，您好，请问如何展示出染色体上某个基因的，或者说某个位点附近的核苷酸多样性值，FST值或者tajimas值。

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SRA数据下载

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我的差异基因是mstrg 开头的，然后做分析的时候这些基因转换不上去

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基因家族鉴定

3 回答

老师，我想知道我在用你们演示的玉米数据提取cds和pep的脚本为什么都运行不对，第一个我是用了你们给的TransDecoder下载地址。第二张图用5.7版本的自己的数据是输出空文件

  • aa1 2025-01-08 19:57
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代码报错

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老师，我想问一下，第一列的1234这种数字代表的是啥呀？我能不能自己添加？