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hic挂载时，选用那个内切酶

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The CDS sequences do not match the gene sequences.

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kneaddata做质控的时候，服务器卡死了，用trimmomatic+bowtie2分开跑是可以的吧

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使用FUSION进行TWAS分析权重训练问题

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老师，我要做泛基因家族分析中泛基因列表构建，我是不是只需要把data数据的基因组和gff文件链接过去，不用再建文件夹下载了，然后一步步做Rstudio的操作么，我需要下载pangenlist里面的哪些文件到自己的服务器？

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老师我的基因组都是Scaffold，没有染色体级别的基因组，这种适合做泛基因家族鉴定么。我是在BnPIR(http://cbi.hzau.edu.cn/cgi-bin/rape/download_ext)下载的

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泛基因家族分析之基因家族成员选择压力分析

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#保留蛋白编码基因

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老师您好，在做比较基因组提取CDS、蛋白序列和最长转录本时候，提取出的文件是空的，这是什么原因，请老师解惑

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染色体定位 单位如何标识？用mapchart如何标识标尺单位。

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你好，

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SV与家族基因的保守结构域分析

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泛基因家族分析-SV和基因表达量

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进化树制作，背景我设定的只是一段，为什么提交之后全部基因都有背景。

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基因家族分析时，提取cds与pep序列报错显示 no sequence

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共线性分析出现如下报错，但是还是有结果。而且也能出图。这是怎么回事呢

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tree_tax出错

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连接镜像被拒绝

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prodigal预测基因后会去除partial=00的contigs

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老师，我最后做出来的PAV热图没有同源基因，分析了两个原因。