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summarize_taxa.py缺少脚本

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生物信息学入门看点啥

  • 2024-08-31 15:48
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koeken报错

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5 picard生成dict文件失败

  • BJFU 2024-09-26 21:50
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老师，在pca分析作图中需要分组文件，如果我的群体没有分组文件，那么应该如何确定分组，是先用structure分析确定最佳分组后再做其他的pca和进化树吗？

  • WHR 2024-09-11 17:51
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能使用mummer进行基因组组装的辅助挂载吗？如果可以，能分享一下流程吗？

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泛基因家族ka/ks分析，生成 .axt文件时报错，查看直播回放发现老师是cp过去的结果，我按步骤怎么都做不出来，中间没少任何一步

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结构变异注释步骤生成文件为空

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关于代谢组学的原始文件处理

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老师，为什么我在网页上处理好了图，把那个线条变成了第二张图所示的，然后一导出，就变成了第一张图那种线条形状的了，有什么方法能正常导出吗老师？另外就是，我的图只能用这种截断的线条，，那我的标尺需要怎么改呢老师？因为他不是要把正标尺改为负标尺吗？

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docker创建共享文件夹失败，docker run rm it -v D:\gwas anlysisl:work omicsclass/pop-evol-gwas:v1.2命令后出现invalid reference format怎么解决

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在T2T基因组直播课程中基因组hic挂载染色体部分，老师说对于高杂合基因组还需要用一个软件过滤等位基因假信号，是什么软件，我没听清；还有个问题如果只用nextdenevo进行数据校正不组装，那么校正后的数据在哪个文件夹？

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putty 跑保留最长转录本，跑了一两个小时后突然没反应了，出现inactive

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请问老师，泛基因家族的数量是根据什么定的啊，如果说几个基因组共有的加上单个基因组独有的话，怎么还会有的基因不存在任何一个基因组呢？

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老师 这是你们给的测试数据，我在注释的第一步就遇到下面的问题，需要怎么处理， 还有一个问题就是我自己组装我的数据的时候 遇到的问题就是你问我用的是什么测序仪，我也回复啦一个星期啦，我的问题是不能解决啦吗，就是这一个问题，已经一个多月啦还是老样子，

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3 在进行转录组分析时，在自己的服务器上怎么使用以下命令，请老师帮忙解答；（没有root权限，docker镜像用不了，想在外部自己的服务器中使用）

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Treemix分析中无法生成input.frq.strat文件

  • per 2024-06-30 16:16
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老师您好！我在使用ParaAT是报错，提示Generating homologous group files for alignments: 0，请问这个如何解决？

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PSMC

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Sripts插件缺失，之前下了scripts的文件，然后在本地跑代码的时候跑出来文件发现为0，后找对接老师拿了压缩包，导入后还是不对，后检查，发现还是少了这个插件