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PAV基因列表中的基因1和基因2出现重复

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3 为什么我的WGCNA分析运行到这一步就卡住了，但是显示分析中，WGCNA分析如何筛选数据啊，恳请各位大佬帮帮忙

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老师您好，请问如何批量提取不同基因组中的目标基因家族成员

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老师，我按照多样本的代码生成gvcf文件后，发现并没有视频里讲解所说的tbi格式的索引文件，这是怎么回事呢，我需要怎么做啊

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绘制PAV热图时，一个品系缺失，26个品系只有25个品系被画出来

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老师这是什么意思，为什么会这样，我要怎么办

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宏基因组单独组装后的contigs需要注明来源以构建基因丰度表，混合组装呢

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老师 我想问一下就是这个snp的统计是哪里呀 我视频里面看啦 说是SNP_gene_ann.stat里面的最后一列total ，但是我统计出来有一千五百多万，才36个个体 会不会太多了呀，还是直接wc -l对vcf文件进行统计呀

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通过GWAS分析找到显著snp后，对这个snp进行单倍型分析，把群体分为了3种单倍型，结合表型做了显著性分析，发现3种单倍型的表型不存在显著差异，这样的结果说明这个snp是阴性结果吗？

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获取UGT家族基因的泛基因编号，运行代码后内容为空

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重测序

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老师，我提取cds ，pep用基因的ID，作为序列的ID命令。运行出来"No such file or directory; can't open file ./.longest_isoform.gff3"但是我打开输出文件看是有数据的。是不是不用管No such file or direc...提示

  • aa1 2025-01-09 16:36
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线粒体基因组组装挑选contigs的标准是什么？

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命令行复制

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

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老师 就是我也买啦那个群体遗传的那个课程 我看啦一下 就是您课程上讲解的是下载参考基因组是拟南芥 我是做越峰杜鹃的 然后我重测序的也是 我的参考基因组是不是我自己组装出来越峰杜鹃的那个基因组啊 还是其他的呀 这里我没懂

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请问大家，为什么将含有序列的文本txt格式改为fasta之后，用MEGA打开显示空白，直接打开文本也是显示空白

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老师您好，在做连锁不平衡分析的时候出现这样的结果要怎么解决啊

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老师您好，在做GWAS分析的时候，性状数据不是连续的数字，是0，1这种，这样的数据也可以按照上课讲的流程分析吗？性状数据没有多年数据，在后续的分析步骤中，不定义tassel_trait这个变量可以吗？

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同学你好，请问你能找到pan-genome:v1.0这个镜像吗？我登上去发现镜像是空的