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我在做T2T，docker下载T2T镜像错误

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20 GFF文件格式不标准

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这种情况怎么解决

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老师，在putty中如何操作；既可以做自己的数据，又不用删掉示例数据呢？我现在想上传自己的数据；是不是得把之前的demo和data都删掉；我怕内存不够；还是说内存足够，上传的时候传成data2呢

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基因型文件里面包含了snp和indel，怎么Indel和表型进行关联分析，是需要把vcf文件转换一下格式嘛，具体代码是什么，期待老师的解答

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老师您好，我在运行collapse_samples.py这段代码用于物种注释时出错，出错信息为 qiime.parse.QiimeParseError: No header line was found in mapping file.请问该如何解决？

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请问跟着教程做的时候，无法下载omicsclass/reseq:v1.1，老师您能提供一份在线下载链接吗？

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这是我的文件名泛基因家族提取cds和pep的脚本应该怎么改呢

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docker

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基因家族分析中的顺势作用元件分析问题

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课程里使用bracken对kraken结果进行修饰我发现全部都注释到种水平了这个是bracken算法的设置原因吗？

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请问下你docker search omicsclass怎么解决的，我也遇到了一样的问题

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怎么从泛基因组call SNP呢？

  • 2025-03-05 17:34
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#提取cds 用基因的id，作为序列的id；；1.这条指令如何修改，我想保留第一个pbr013511.1，这条指令只能保留中间部分 2.提取完cds和pep后，>DAnjou后面的内容，没有基因ID，ANQ为他的gff3文件 3.同样也是提取完cds和pep之后，>后面内容无基因id；DL为gff文件

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请问我想注释出碳氮磷硫功能基因及丰度，有什么教程吗

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老师，您好， 我想问一下选择清除分析fst和pi结合的图的曲线为什么变细了？ 我用红色框线圈起来了

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宏基因组分析，用来分组的metadata格式具体是什么？

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老师，您好，我正在泛基因家族分析，想问课程中用到的结构变异的vcf文件all_merge.vcf是泛基因组全基因组范围的变异吗，

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修改样本名称

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如何删除01.data prepare呢？