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使用GSDS来可视化基因的顺势作用元件，发现有些元件显示不出来。只能修改那些元件颜色和形状，不能移动元件标识。用那个GSDS自带的edit功能，进去之后之前修改的元件形状又变成修改之前的样子，edit只能移动不会修改元件颜色和形状，也不会保存到本地。请老师给想个办法？

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存在缺失分析

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老师，图1是我用图2的代码实现的，现在我想仿照提取细胞亚类的方式，使用图3的代码单独提取TIP这个maker基因，不提取整个cluster3，这个代码可以实现吗，或者是否有其他代码可以使用

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有参转录组数据分析，样品和基因组比对效率只有零点几，这是为什么？

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PSMC分析

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请问老师，泛基因家族鉴定开始做自己的物种时，怎么在docker 里上传自己需要做的物种的数据

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Arabidopsis_thaliana.TAIR10.56.gff3.gz 课程资料发我的gff文件里面没有parent信息，影响基因家族分析吗？

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共线性分析进行blast+比对，输出屏幕出现waring，这是啥意思啊?影响比对结果吗？最后能输出blast文件

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windows安装Aspera Connect软件

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老师，我的Fam_gene.list、PAV_draw.list、PAV_gene.list都正常，但是pav图出现了异常，只有两个PHY基因

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dadi分析

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A基因家族的家族成员一共25个，但是23个成员是一个domain，只有是两个domain,这种情况，比较这个基因家族里面不同成员的蛋白全长是不是不合适？不容易得到25个成员的全蛋白进化树？

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服务器超过5个线程，被killed。请问怎么使用名单规定线程？下面命令如何修改规定线程。

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基因家族分析时，提取cds与pep序列报错显示 no sequence

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Te amo老师 就是 我在做共线性分析哪里，遇到下面这个问题，就是遇到生成的*.axt文件是空的，然后报错我截屏在下面啦，您帮我看一下嘛 谢谢，上面的那个问题我已经解决啦。

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你好，

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泛基因家族分析

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老师，就是我组装叶绿体基因组，组装出来怎么是这个鬼样子啊，而且只有embplant_pt.K105.scaffolds.graph1.1.path_sequence.fasta，没有1.2， 这是什么问题呀

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prodigal预测基因后会去除partial=00的contigs

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你好老师，我05以后的脚本在rstudio server 突然打不开应该怎么办

  • Nier 2025-09-27 19:49