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老师，我更换镜像了，但本地镜像一直加载不了，显示如下。然后，我在服务器上，导入镜像，运行docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v2.0做了泛基因集构建。之后继续做其他分析，然而，运行镜像时一直出错，进不去，错误显示如下。

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拟时分析筛选出的差异基因数量太少，有没有可以调整的参数去增加筛选数量

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老师，在泛基因列表构建时，总共113个基因组，成功提取了最长转录本，提取bed文件，但提取cds文件时，有一个文件A10总是失败，不知道什么原因。

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老师，软连接以后，我的样本名后面加了？这样对吗 在软连接时，我将Rstudio中的gz去掉了，因为我的data数据没有gz

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verkko组装后怎么生成.hic和.assembly文件

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老师您好，我在做泛基因家族分析中存在缺失分析得到的基因家族泛基因编号文件和泛基因列表一样，不知道为什么

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ka/ks分析，有的基因没有axt文件

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5 请问利用jcvi整理泛基因列表，做JCVI做共线性分析时，一直提示/bin/bash: lastdb: command not found，是没有安装Last软件包吗？目前使用的镜像是购买课程时老师提供的，数据是26个玉米基因组数据（由于空间不足，只用了19个基因组）

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全基因组关联分析GWAS教程中的beagle填充问题

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老师，我正在做泛基因家族分析，在构建泛基因列表时，整理完matrix.txt文件，进一步进行矩阵整理时，得到的pangene.txt为什么都是nogene呢，另外，我们老师，我正在做泛基因家族分析，在构建泛基因列表时，整理完matrix.txt文件，进一步进行矩阵整理时，得到的pangene.txt为什么都是nogene呢，另外，我们

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基因组数据的下载

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dadi

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xpclr绘图

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老师，在泛基因集构建时JCVI的比对，出现以下错误

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老师就是做到xpclr和TajimaD的时候 出现下面的错误 要怎么解决呀

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老师我在解压eggnog.db.gz文件时显示失败

  • Oho 2025-03-08 09:57
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关于填充gap后的polish

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IBD 计算2

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泛基因集构建中JCVI做共线性分析构建完一半数据报错 core dumped

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5 单细胞测序拟时分析没有“seruat”这个包报错