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合并CNV结果失败

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PCA

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dadi

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转录组比对中，同源性很高的两个基因比对不正确

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绘制热图所用数据的样本或处理如何确定

  • 2025-05-23 15:37
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泛基因组分析，磁盘配额不足

  • Yang 2025-07-26 16:31
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泛基因组运行cat ../id.txt|while read ind;do agat_sp_keep_longest_isoform.pl --gff ./${ind}.gff3 -o ./${ind}.longest_isoform.gff3命令时提醒以下情况，请问具体该怎么解决

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老师您好，做比较基因组分析时，单拷贝同源基因的这个文件是空的Orthogroups_SingleCopyOrthologues，并且orthofinder文件夹也是空的，是什么原因造成的

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在进行进化树分析时，运行出clean.sorted.vcf.gz文件后，后续文件跑不出来了，报错原因如图所示

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泛基因家族-PAV

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泛基因家族转录表达

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泛基因家族分析进化树构建

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老师，这是我做提取可靠基因家族成员的结构域序列用到的文件和代码，不知道哪里除了问题导致domain_final.bed只有一个基因

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共线性分析，绘图报错。看不懂，请问是啥意思？

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运行自己的数据绘制Upset图，这个报错是什么原因呢？

  • halo 2025-08-27 18:27
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单倍型分析

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老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？

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老师您好，我运行MCMCtree的时候，为什么程序就不运行

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老师，这是我做出来的PAV热图，每个基因都是物种独有的，这个PAV热图效果是不是不好，这个PHY家族是否合适继续研究，没办法做聚类分析这些了

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老师，就是我在用misa鉴定ssr的时候，把文件输进去出现下面这个问题怎么解决，用你们提供的数据也是一样的问题，我找不到原因