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在PAV分析绘制热图的时候，运行R脚本出现如下错误，请问怎么解决？这个aplot安装包安装也一直安装不了

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组学大讲堂的一个T2T组装培训课，在进行组装前先除去了和细胞器DNA高度相关的reads。但是我看现在大部分的文章没有特别处理细胞器的DNA，是在组装的过程中已经被除掉了吗？

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老师请问一下我在做hic挂载练习的时候运行到使用bwa的aln和sampe进行比对，这里问什么不运用mem这个功能进行比对呢

  • Nier 2025-10-17 16:36
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但我后面加了$之后它先是报错没有index目录，创建之后运行不报错但没有运行结果

  • xxx 2026-01-06 14:41
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泛基因家族分析PAV_gene.list中基因数量，少于gene.pep.fa中序列的数目

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hmmsearch运行时异常终止

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下图的文件是怎么得到的

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老师我已经把压缩包cat到一起并且更改了容器的名字为什么还是不行上一个问题的链接在这里因为无法在上个问题继续放上图片https://www.omicsclass.com/question/8300

  • Nier 2026-01-20 18:57
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老师下面这个问题怎么解决呀，我换一个物种他就可以完成，

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泛基因组

2 解决

10 成功启动镜像，进入容器，把课程资料下载到本地并解压缩，还是找不到课程资料

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老师，您好！在变异结果注释ANNOVAR这部分里面，结果出现报错。如何解决？

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conda

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叶绿体比较基因组分析你好，我组装好的Fasta文件是一条一条的，课程里重复序列和多态性分析用的示例文件是总all.fasta,我需要怎么能整合起来，一条条好像也分析不成

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nucmer比对出现问题，导致部分样本没有结果

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在全基因组选择育种课程中，所有需要预测的样本（在 pred_ID.csv 中列出的ID），必须已经存在于那个巨大的基因型文件 imputed_snp.raw 中，是否就意味着我只能预测现有群体的缺失部分？我需要预测新的群体，那这 pred_ID.csv文件该如何编写？

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10 成功启动镜像，进入容器，把课程资料下载到本地并解压缩，为什么找不到课程资料

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为什么这两次是一个文件，只是改变了核数，输出的结果却不一样了

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重复序列分析

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想知道sh scriptdir/index.sh怎么创建才能用于索引建立，输入指令显示不存在

  • xxx 2026-01-06 10:38