空间转录组样本在一张芯片上

我的空间转录组的3个样本放在了一张芯片上,在用scanpy和seurat质控的时候如何设置,将这三个样本区分开来?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你的是华大的空间转录组数据吗?可以先一起分析,最后再分开分析,


需要分开显示可以利用华大的steromap,可视化软件 圈选出 一张芯片上不同区域坐标,识别坐标中的不同样本的 barcode信息,然后添加样本分组信息到metadata中,方便后续拆分样本显示;


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  • gz_li 提出于 4小时前

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