我的空间转录组的3个样本放在了一张芯片上,在用scanpy和seurat质控的时候如何设置,将这三个样本区分开来?
你的是华大的空间转录组数据吗?可以先一起分析,最后再分开分析,
需要分开显示可以利用华大的steromap,可视化软件 圈选出 一张芯片上不同区域坐标,识别坐标中的不同样本的 barcode信息,然后添加样本分组信息到metadata中,方便后续拆分样本显示;
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