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hisat2

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Ran out of memory; automatically trying more memory-economical parameters.转录组建索引一直弹出这句话

jianbiancao 2023-12-12 19:02:31

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sam 转换成bam 格式并排序时，没转换成功。reads 与基因组进行比对map这里出错。

星野 2022-04-03 16:51:09

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1513浏览

reads 与基因组进行比对map 是程序正常运行，但sam文件为空，求老师赐教

WH 2022-02-18 21:34:03

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hisat2软件做转录组数据比对时出现的一个报错，百思不得其解，求各位大佬帮忙看下

祝不知山 2022-01-17 17:30:27

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2634浏览

老师您好，我在hisat2建立索引时报错，向您求助

qejknjznckznjh 2022-01-04 14:05:25

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转录组上游分析之定量比对Hisat2出现内部异常错误

Gery-Xu 2021-09-15 00:28:41

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4951浏览

有参转录组比对

留意 2021-07-06 13:15:57

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Hisat2比对

韩小赖 2021-04-13 11:24:50

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2708浏览

hisat2比对时出现报错

韩小赖 2021-03-31 14:56:06

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2810浏览

RNA-seq分析，用index.sh建立索引exons.tsv文件为空

香蕉芝士卷 2020-05-30 22:46:54

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2910浏览

用hisat2软件建立index为什么要先制作splicesites.tsv和exons.tsv文件

大k 2020-04-01 00:33:29

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2835浏览

有参转录组自主分析学习过程中遇见的问题

lord of king 2020-03-08 12:27:42

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5606浏览

hisat2建立index时的问题

章鱼哥吹笛子 2019-12-13 18:20:49

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老师，你好。在做有参转录组分析，准备的文件有基因组注释文件gtf,cds,pep(其中cds,pep都是fasta格式的序列文件），命令如下。其中第一个截图是参考pep文件，比对率为0，；第二个结果是参考cds文件，比对率为57.81%，比较低，这是哪里出了问题吗。另外所以准备的文件应该是cds文件而不是pep文件是吗

scau_bioinfo 2019-12-07 17:37:45

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用 hisat2 建索引时出现 “is not reverse-deterministic, so reverse-determinize...”

落井不忘下石人 2019-11-03 18:48:21