生存分析 - 组学大讲堂问答社区

生存分析

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老师，想请教一下TCGA基因表达数据的问题，我从xena.ucsc网页上下载了基因表达数据TCGA-CESC.htseq_counts.tsv；然后发现该数据中只有Ensembl格式的基因ID ，没有SYMBOL格式的。所以接下来进行基因ID格式转换，却发现同一个SYMBOL ID对应的多个Ensembl格式的ID，想问下老师，这种情况该怎么处理？同一个SYMBOL ID所对应的多个Ensembl格式ID的基因表达数据应该留下哪一个？

Bella 2021-10-25 16:15:08

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老师，请教您一个生存分析的问题，为什么phenotype的删失数据天数一列中会出现alive time=0的情况,是病人还没开始实验观察就去世了吗？

Bella 2021-10-21 16:05:44

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生存分析：老师,我看到了这个生存分析的代码在利用索引定义一个新的向量时先定义了一个,想请教一下您他为什么刚开始要定义一个纯0向量呢,先谢谢您啦

Bella 2021-10-21 11:25:26

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计算每一个单因素cox分析，lapply函数，好久都没有反应，怎么看进度啊，要等多久啊？

杨娃娃 2020-08-06 07:38:25

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你好，我想问下大佬做生存分析，怎样用ROC曲线寻找cut-off值？

那妙谷 2020-06-19 13:43:45

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TCGA生存分析cut off

YUE 2019-09-05 13:47:52

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生存分析中单因素cox循环的问题

baconchan 2019-03-19 01:28:20

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生存分析出现的问题

蜡笔小石 2019-02-06 13:51:16

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TCGA数据做完cox生存分析，验证完后，还可以接着做什么后续分析？

microRNA 2019-01-30 09:42:57

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老师您好，在跑TCGA生存分析的时候，在进行lapply()的时候一直报错。Error in terms.formula(formula, special, data = data) : ExtractVars里的模型公式不对

爱睡觉的秋刀鱼 2018-12-01 11:35:50

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TCGA生存分析课程risk socore问题

张晓奇 2018-10-28 19:32:39

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TCGA生存分析cut off值疑问

小星星 2018-09-23 23:46:33

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TCGA生存分析

Roger.medico 2018-09-17 22:38:53

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TCGA生存分析报错

Roger.medico 2018-09-17 00:06:53

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老师您好：关于TCGA的生存分析，用训练集train来做单因素的生存分析筛选有意义的基因，为什么在鲁棒性分析的时候不用训练集，而是整个数据集exprSet呢？

爱睡觉的秋刀鱼 2018-09-14 20:11:08