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用GATK call SNP时报错
GATK
甜辣辣
2024-07-17 11:29:47
1
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在singuarity使用gatk时调用不了HaplotypeCalle指令
GATK
233
2024-07-03 14:57:11
1
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649
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GATK 报错
GATK
Elf
2024-04-03 13:17:37
1
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使用GATK的GenomicsDBImport合并gvcf导入db时报错Unexpected compressed block length: 1 for /work/GATK/BN14.g.vcf.gz
GATK
薄信
2024-03-14 11:38:27
2
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gvcf转换成vcf
GATK
蒙头学
2024-03-13 11:07:50
1
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733
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合并g.vcf
GATK
Jay
2024-03-12 19:22:08
1
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821
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合并g,vcf
GATK
Jay
2024-03-11 19:42:35
2
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用samtools call出单个样本的rawvcf文件,合并之后发现samtools不像GATK的文件gvcf那样保存与参考基因组相同的位点,而是在合并之后都变成了缺失,想咨询一下samtools call出的这组数据还可以用吗,有什么办法?
samtools
GATK
东篱
2024-02-20 10:57:33
1
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913
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变异结果过滤,gatk VariantFiltration
GATK4
GATK
yangxiang666
2024-01-22 10:15:09
1
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771
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GATK
GATK
shidandan
2023-12-13 16:46:28
1
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1047
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老师,请教一下,用gatk call g.vcf.gz格式的文件是,运行中断了,请问怎么样才能和之前跑的数据接着跑,而不是从零开始呢
GATK
红红火火
2023-10-30 15:14:43
1
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1711
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合并gvcf时程序终止
GATK
诈胡
2022-08-16 10:23:40
2
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7307
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合并gvcf的问题
GATK
gatk4 HaplotypeCaller
gvcf
米生花
2022-08-11 23:47:55
1
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1638
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老师你好 我在用gatk合并gvcf文件的时候 系统提示有一个样本的gvcf文件某一行数据出现问题 这种情况应该怎么解决 是需要重新生成这个样本的gvcf文件吗?
GATK
St.Sky
2022-02-26 16:33:10
1
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3027
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GATK HaplotypeCaller - Shutting down engine
GATK
omicsgene
2021-09-17 09:37:36
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