全部 - 热门的文章 - 第5页 - 组学大讲堂问答社区

带推断线的进化树

在一些群体遗传进化的文章中，会展示整合了物种分类和大量系统发育推断（灰色虚线）的进化树，接下来小编将绘图代码贴在下面，效果如下图： 1.准备数据准备3个文件，其中两个nwk格式的树文件...

0
0
Ti Amo
发布于 2025-12-18 14:49
阅读 ( 414 )

组学助手--组学大讲堂官方助手

如果您有关于组学大讲堂培训、云服务器相关的售后问题，或者需要进行续费操作，请扫描下方二维码联系我们。

0
0
omics007
发布于 2025-11-24 14:22
阅读 ( 388 )

空间转录组细胞分割

https://www.bilibili.com/video/BV1Ct421H7ST/?spm_id_from=333.337.search-card.all.click&vd_source=6cc688872dbaeabe125ff35d0ca9e710

0
0
omicsgene
发布于 2025-12-17 18:16
阅读 ( 366 )

bam文件出现负坐标

不管是重测序或者是有参转录组，很重要的一环就是将测序数据比对到参考基因组上。一般来说，常用比对软件都可以正常运行结束，但是当碰到超大基因组的时候难免会碰到一些问题，这些问题有的时候...

0
1
Ti Amo
发布于 2025-12-18 15:27
阅读 ( 363 )

IF=4.8|对4种天南星科植物基因组进行WRKY基因家族分析，并分析其在魔芋中的表达

“ 2025年12月 Frontiers in plant science杂志发表了一篇题为“Genome-wide characterization of WRKY family genes in four araceae species and their expression analysis in Amorphophallu...

0
0
rzx
发布于 2026-01-05 16:58
阅读 ( 361 )

宏基因组的基因组binning-BASALT 介绍和用法

宏基因组的基因组binning（分箱，即将测序数据中的reads或contigs分类到不同的基因组中）是一个关键步骤, 常用的软件是2018发表的metawrap,但是他一直没有更新, 这篇文章将介绍一个较新的binnin...

0
0
xun
发布于 2026-01-05 17:33
阅读 ( 356 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-LUAD(GSE123902)

0
0
omicsgene
发布于 2026-01-13 14:21
阅读 ( 346 )

eQTL结果使用coloc共定位分析

共定位分析（Colocalization Analysis）之前有提到过,它是一种统计方法，旨在确定GWAS识别的与复杂性状或疾病相关的遗传变异位点是否与xQTL共享相同的因果变异。这种分析帮助揭示GWAS信号的潜在...

0
0
xun
发布于 2026-02-09 09:07
阅读 ( 327 )

IBD分析

IBD（Identity by Descent，同源片段分析）是群体遗传学中用于检测个体间共享祖先片段的分析方法。一、IBD分析的基本概念 IBD分析是通过检测基因组中共享的、未发生重组的DNA片段，推断个体...

0
0
Ti Amo
发布于 2026-01-30 14:05
阅读 ( 308 )

IF=4.2 | 杏黄李关键耐寒代谢途径的转录组代谢组联合分析

0
0
安生水
发布于 2026-01-29 18:30
阅读 ( 295 )

LeafCutter可变剪切注释

目前主流的探究转录组数据的可变剪切的算法是基于estimate isoform ratios 或者 exon inclusion levels ,但是可变剪切本跟正常转录本重合的比例很大，存在技术误差也，且他依赖于基因现有的注释...

0
0
xun
发布于 2026-01-05 17:27
阅读 ( 284 )

小鼠单细胞转录组方法参考 method

小鼠单细胞转录组方法

0
0
omicsgene
发布于 2026-01-23 13:09
阅读 ( 283 )

python版本xpclr报错

报错内容： ImportError: cannot import name 'romberg' from 'scipy.integrate' 可以看一下，基本上是这个脚本的第六行存在调用： ~/biosoft/conda/miniconda3/lib/python3.12/site-package...

0
0
Ti Amo
发布于 2026-01-21 15:57
阅读 ( 269 )

STAR构建基因组索引报错

报错提示： Fatal LIMIT error: the number of junctions to be inserted on the fly =1412348 is larger than the limitSjdbInsertNsj=1000000Fatal LIMIT error: the number of junctions to...