idealTree:lib: sill idealTree buildDeps 安装JupyterHub 卡住
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- omicsgene
- 发布于 2024-09-29 17:18
- 阅读 ( 974 )
omicsgene
gtfToGenePred报错
使用gtfToGenePred的命令和报错： gtfToGenePred -genePredExt Drosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf refFlat.tmp.txtDrosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf (GFF not supported by t...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-06-13 11:47
- 阅读 ( 969 )
Ti Amo
PASA报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc
通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释，其中PASA是转录组注释的常用软件。 报错： 把三代转录组数据投入PASA是出现报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, as...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-09-30 13:50
- 阅读 ( 968 )
组装"预实验" | 基因组调研图
基因组调研图有助于了解即将组装的这个物种的基因组复杂程度，为后续的正式的基因组组装去提供一些依据。基因组的复杂程度可以从基因组大小，倍性，杂合度，重复率等方面去进行评价。 用什么来...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-07-30 15:39
- 阅读 ( 957 )
单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)
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- omicsgene
- 发布于 2024-07-22 18:21
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安生水
add a Convex Hull with module
有的文章会在模块化的群落里加上Convex Hull ,类似这样,如何实现呢,可以借助ggforce的geom_mark_hul 比如我们的示例代码稍作修改 library(ggforce) 主要是加了最后一行,的geom_mark_hull...
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- xun
- 发布于 2024-07-11 09:20
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xun
单细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中
单细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中
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- omicsgene
- 发布于 2024-08-29 13:40
- 阅读 ( 919 )
R语言绘制多分组差异分析结果图
R语言绘制多分组差异分析结果图 加载需要的包 2 设置FC和FDR的阈值线 4.3 读入数据
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- 安生水
- 发布于 2024-10-25 13:52
- 阅读 ( 913 )
单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌（HNSCC）(GSE181919)
数据介绍： 来自谷歌翻译： 肝细胞癌（HCC）代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里，我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组：原发肿瘤、门...
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- omicsgene
- 发布于 2024-10-31 14:05
- 阅读 ( 908 )
惊喜价！转录组299元/个
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- 生信老顽童
- 发布于 2024-05-08 09:07
- 阅读 ( 895 )
生信老顽童
SRA Toolkit 工具首次使用提示“This sra toolkit installation has not been configured”
SRA Toolkit 是一套由 NCBI (National Center for Biotechnology Information) 开发的软件工具，用于从 SRA (Sequence Read Archive) 数据库下载和处理生物序列数据。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-09-09 16:31
- 阅读 ( 892 )
每天学习一点点
