当我们想在linux下批量处理数据时,用到的脚本需要达到我们想要处理的效果,这时就需要我们对脚本进行修改编写。 但是对于初学者来说,一些生信脚本是非常晦涩难懂的,google百度得到的回答也...
《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架
python代码到pubmed上搜索关键字,统计每年发文章数量
在使用trinity做de novo的时候,发现软件报错了
“ 2025年2月Frontiers in plant science 杂志发表了一篇题为“ Pan-genome analysis and expression verification of the maize ARF gene family”的泛基因家族文章。” 本研究基于玉米泛基因组...
空间转录组实操课程
deepseek绘图之--FPKM小提琴图
研究探讨了不同饲养策略对甘巴羊生长性能及肠道微生物群落的影响。通过宏基因组和qPCR分析,发现不同饲养策略显著改变了微生物群落的多样性和组成。同时评估了与植物多糖降解相关的酶基因
clusterprofile 支持的物种GO和KEGG富集分析orgdb
单细胞转录组文章
我们进行kegg富集分析之后,除了会得到差异基因和KO编号对应的KOlist信息,还会拿到kegg pathway map的信息,分为html和png的结果展示,大概是这样的结果: 一般来说我们最好检查一下,这里...
组学研究中,数据看不懂、新人难上手、外包成本高,是不是让你头疼不已?别慌,组学大讲堂超级 VIP 来拯救你,助你一键破局! 点此处直达VIP详情页:VIP详情页 点此处联系客服了解详情:客服...
宏基因组测序技术是进行微生物资源开发利用、加速微生态科研深度研究的重要手段。随着高通量测序技术的普及,越来越多的研究人员开始着手与宏基因组分析。 但是,有相当一部分研究人员由于是初次接触宏基因组分析,对分析结果缺乏系统的了解,无法高效的挖掘和研究目的相关的结果,进而影响了文章的发表以及成果的转化。
AI助手帮我解决如何修改kvm虚拟机root密码
AI 写代码之绘制GWAS 曼哈顿图
比较基因组单拷贝直系同源基因数量
ImportError: pycurl: libcurl link-time ssl backend (nss) is different from compile-time ssl backend (none/other)
不同物种进行转录组分析的时候流程大致相同,但是当我们做的物种有一个庞大的基因组,那么流程中有一些参数需要进行修改: 1. Markdup和SplitNTrim的时候不要生成bai的索引,主要是 Markdup的...
GATK是我们重测序流程中经常使用到的软件,他的下载比较简单,但是今天在配置的时候出现了一点小问题 下载 wget https://github.com/broadinstitute/gatk/archive/refs/tags/4.6.2.0.tar.gzta...
在挖掘数据的时候发现有的数据用的是v2版本的,我手里只有全长的和v3-v4的,全长效果没那么好感觉,但是我好久没有看过qii2相关的东西了,有点忘了,刚好最近ai很火,我就尝试用ai帮我构建,过程如下...