预测miRNA前体

1. 寻找前体:将reads比对到参考基因组上。得到fa文件:对输入reads信息重新整理(将不同样本的reads重新整合到一起);arf文件:比对结果。如果想增加比对结果,可以增加参数-q(比对错配数为1...

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  • 发布于 2023-11-01 15:25
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siRNA

什么是siRNA ? siRNA(small interfering RNA 小干扰RNA) 是由 20-25 个核苷酸组成的双链 RNA 分子。一般3’端有两个游离的碱基,通过RNA干扰途径沉默目标基因。 RNA干扰(RNAi) 在RNA干扰...

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  • 发布于 2023-10-18 14:16
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在使用miRDeep进行miRNA预测的时候报错

运行命令:Rhi_mature.fa 是物种miRNA成熟序列;Rhi_hairpin.fa 是物种miRNA前体序列; perl otal_reads_collapsed_vs_genome.arf none -d  -g 100000 -l 500  -m 11 -v -P -n d 报错: T...

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  • 发布于 2023-09-05 13:27
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预测miRNA前体

1. 寻找前体:将reads比对到参考基因组上。得到fa文件:对输入reads信息重新整理(将不同样本的reads重新整合到一起);arf文件:比对结果。如果想增加比对结果,可以增加参数-q(比对错配数为1...

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  • 发布于 2023-11-01 15:25
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