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TWAS分析的原理和工具
TWAS（Transcriptome-wide Association Study）是一种用于研究基因表达和疾病之间关系的方法，通过对全基因组的基因表达数据进行统计分析，以识别与特定疾病或性状相关的基因表达变异。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-11-12 17:29
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每天学习一点点
核苷酸多样性π的计算
核苷酸多样性（nucleotide diversity），记为π，是分子遗传学中一个重要的概念，可以作为一个群体遗传的重要指标去衡量种群的遗传多样度水平，也可以用在单个基因的多序列比对之中找到受选择的...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-11-12 18:14
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Ti Amo
删除指令(rm)报错:"Directory not empty/Device or resource busy"
删除指令(rm)报错:"Directory not empty/Device or resource busy"，是什么问题，如何解决
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- 发布于 2024-10-11 09:57
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安生水
安装R包报错 fail to lock directory
这个错误通常发生在尝试使用R的install.packages函数安装新的包时。错误信息"fail to lock directory"意味着R不能锁定用于安装包的目录，这通常是因为之前的安装进程没有正确完成，导致锁文件（一个隐藏的文件，用于防止同时写入目录）仍然存在。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-10-29 17:32
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IF=13.8 | 青藏高原人群肠道微生物生物标志物的荟萃分析及微生物群衍生的丁酸盐在高海拔适应中的功能
“ 2023年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Meta-analysis identifying gut microbial biomarkers of Qinghai-Tibet Plateau populations and the functionality of microbiota-derived b...
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- xun
- 发布于 2024-11-12 18:10
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xun
组装"预实验" | 物种倍性分析
倍性直接影响基因组的大小和复杂性，不同倍性的物种需要不同的组装策略，了解物种的倍性对于基因组组装至关重要
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- Ti Amo
- 发布于 2024-11-25 15:22
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如何计算基因组中的连锁不平衡
连锁不平衡（linkage disequilibrium,LD）是指在某一个群体中，不同位置上的两个基因座同时遗传的频率明显高于预期的随机频率现象，一般用D，D'和r²来表示LD的程度。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2025-04-27 09:29
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samtools | 提取部分染色体的bam信息
01. samtools提取bam文件中某部分染色体相关信息 samtools view -b -h XX.bam chr1 chr4 >XX2.bam 02. samtools构建bam文件的索引 samtools index XX2.bam
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- rzx
- 发布于 2024-12-19 16:28
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rzx
单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌（HNSCC）(GSE181919)
数据介绍： 来自谷歌翻译： 肝细胞癌（HCC）代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里，我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组：原发肿瘤、门...
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- omicsgene
- 发布于 2024-10-31 14:05
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