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Win11彻底卸载WSL2系统（去除导航窗格Linux图标）

Win11彻底卸载WSL2系统（去除导航窗格Linux图标）

R语言计算两组数据相关性及对应p值的方法——psych包和Hmisc包

1. psych包的corr.test()函数 2. Hmisc包的rcorr()函数

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-07 13:14
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R及R包的更新、移除、卸载

之前的笔记分享过安装R包的三种方法，以下是关于R及R包的更新、卸载和删除。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-02-22 11:21
  • 阅读 ( 3981 )

NCBI下载SRR并转换为fastq文件

想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据，看了一些下载教程，方法各异，看完思路还是不清晰，以下记录我的操作步骤，仅供参考

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  • 星莓
  • 发布于 2022-12-09 11:56
  • 阅读 ( 3825 )

OPLS-DA分析

OPLS-DA分析，全称正交偏最小二乘法判别分析（OrthogonalPartialLeast Squares-DiscriminantAnalysis），它是在PLS-DA分析方法基础上，加入了正交变换的矫正，能够将X矩阵分解成与Y相关和不相关...

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  • rzx
  • 发布于 2023-02-17 10:43
  • 阅读 ( 3531 )

最全进化树构建知识点大盘点

最全进化树构建知识点大盘点

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-10 15:56
  • 阅读 ( 3326 )

R报错‘length(x) = 12 > 1' in coercion to 'logical(1)’

运行R报错： 解决： 将脚本中group$group == treat || group$group == control中“||”改为“|”，即改成group$group == treat | group$group == control || 和 | 都是表示“或”，区别是||只要满...

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  • rzx
  • 发布于 2023-02-10 14:26
  • 阅读 ( 2981 )

全基因加倍/复制（whole genome duplication, WGD）

全基因加倍/复制（whole genome duplication, WGD）

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-02 17:24
  • 阅读 ( 2903 )

基因组重复序列分类

重复序列是指基因组中频繁出现的相同或对称的DNA片段，在植物基因组中占有很大比重，根据重复序列在植物基因组中的组织方式不同进行分类。

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  • 星莓
  • 发布于 2022-12-29 17:42
  • 阅读 ( 2719 )

Gene ID、Gene Symbol、UniProtKB等ID的转换你会么？

我们在做数据分析时，经常会遇到不同数据库的基因ID不统一的情况，为了方便后续的数据分析，需要进行基因ID或者名称之间的转换。今天小编就给大家介绍几个在线转换的网站。 Uniprot基因ID/名称...

Minimap2安装与使用

minimap2是生信大牛Heng Li在2018年发表的三代序列比对工具。与传统的bwa相比，Minimap2可以用于三代测序， 也支持 splicing awared 比对；与一些传统三代比对工具相比，Minimap2 速度非常快，...

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  • 星莓
  • 发布于 2023-05-12 11:07
  • 阅读 ( 2330 )

保姆式教程！手把手教你使用Simplot，绘制高大上的序列相似性图片

保姆式教程！手把手教你使用Simplot，绘制高大上的序列相似性图片

将fasta序列多行变单行——使用 awk 或 seqkit 或 python

fasta序列多行变单行

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  • 星莓
  • 发布于 2022-12-26 16:03
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win11/win10安装最新版本的docker

win11安装docker

基因家族分析课程更新-批量进行kaks计算

基因家族分析课程更新-批量进行kaks分析

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-01-07 18:24
  • 阅读 ( 1915 )

MNP标记设计

MNP标记设计

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  • 安生水
  • 发布于 2023-05-08 16:22
  • 阅读 ( 1895 )

O2PLS-DA分析

两组学数据的正交偏最小二乘法判别分析（2-way orthogonal Partial Least Square with Discriminant Analysis ） O2PLS 模型用于两个数据组间的整合分析，包括系统生物学组学间关联、分子调控...

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  • rzx
  • 发布于 2022-12-19 14:20
  • 阅读 ( 1880 )

利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树mcmctree

利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-02-27 20:46
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bam文件格式详解

BAM就是SAM的二进制文件，具有更小的存储空间，并且许多下游分析工具使用的是BAM格式。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-05-16 10:00
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2023年秋季线下/直播培训火热报名中！

疫情已经结束，暌违已久的组学大讲堂线下培训回归了！这个暑期，组学大讲堂为大家准备了丰富多样的培训课程。