在微生物组研究中,揭示群落组成与动态变化是核心任务。无论是16S rRNA测序、宏基因组分析,还是环境样本的物种丰度比较,研究者常需面对一个关键问题:如何直观展示多个样本在不同分类水平(如...
宏基因组测序技术是进行微生物资源开发利用、加速微生态科研深度研究的重要手段。随着高通量测序技术的普及,越来越多的研究人员开始着手与宏基因组分析。 但是,有相当一部分研究人员由于是初次接触宏基因组分析,对分析结果缺乏系统的了解,无法高效的挖掘和研究目的相关的结果,进而影响了文章的发表以及成果的转化。
宏基因组的基因组binning(分箱,即将测序数据中的reads或contigs分类到不同的基因组中)是一个关键步骤, 常用的软件是2018发表的metawrap,但是他一直没有更新, 这篇文章将介绍一个较新的binnin...