软件工具 - 热门的文章 - 组学大讲堂问答社区

Treemix 软件：群体基因交流分析的得力工具

在群体遗传学研究中，我们常常渴望揭开不同群体之间复杂的遗传关系以及基因流动的神秘面纱。Treemix 是一款专注于推断群体间基因流的软件。它通过构建群体遗传模型，能够有效地分析群体间的遗传...

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Ti Amo
发布于 2025-04-30 10:31
阅读 ( 5445 )

让AI帮你处理数据，绘制图表！让你强到可怕！

随着DeepSeek等AI人工智能的迅猛发展，我们作为新时代的生命科学从业人员也要充分利用时代红利来辅助我们的研究。今天要给大家推荐2场超实用的直播小课-《让AI帮你绘图》和《让AI帮你处理数据》...

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红橙子
发布于 2025-04-16 20:39
阅读 ( 4007 )

deepseek绘图之--FPKM小提琴图

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安生水
发布于 2025-05-14 09:24
阅读 ( 3695 )

GATK配置问题的解决

GATK是我们重测序流程中经常使用到的软件，他的下载比较简单，但是今天在配置的时候出现了一点小问题下载 wget https://github.com/broadinstitute/gatk/archive/refs/tags/4.6.2.0.tar.gzta...

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Ti Amo
发布于 2025-04-23 15:15
阅读 ( 3047 )

cactus下载

不同物种构建泛基因组的时候需要用到Progressive Cactus 参考文章：Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomic 下载：软件github：https://github.com/Comp...

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Ti Amo
发布于 2025-08-07 11:15
阅读 ( 978 )

cactus报错：Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus XML

报错：运行cactus-pangenome的时候报错： [MainThread] [I] [toil-rt] cactus_consolidated:ERROR: ERROR: Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus...

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Ti Amo
发布于 2025-07-07 17:09
阅读 ( 944 )

孟德尔随机化(MR)

前面的文章中我们给大家介绍过eQTL和sQTL的概念, 大体总结一下，eQTL是指基因组上的一些突变可以改变相关基因的表达，sQTL是指这些突变同时也会导致可变剪接的差异,实际上这两个都是归于一个叫...

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xun
发布于 2026-01-05 17:41
阅读 ( 775 )

python版本xpclr报错

报错内容： ImportError: cannot import name 'romberg' from 'scipy.integrate' 可以看一下，基本上是这个脚本的第六行存在调用： ~/biosoft/conda/miniconda3/lib/python3.12/site-package...

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Ti Amo
发布于 2026-01-21 15:57
阅读 ( 328 )

STAR构建基因组索引报错

报错提示： Fatal LIMIT error: the number of junctions to be inserted on the fly =1412348 is larger than the limitSjdbInsertNsj=1000000Fatal LIMIT error: the number of junctions to...