R语言计算两组数据相关性及对应p值的方法——psych包和Hmisc包

1. psych包的corr.test()函数 2. Hmisc包的rcorr()函数

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-07 13:14
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dQTL.seq方法研究基因定位

dQTG.seq方法包含dQTG.seq1、dQTG.seq2、smoothLOD、C'、Δsnp index、ED六种计算方法。 其中dQTG-seq1方法利用F2群体极端池标记等位基因数目来预测其基因型数目,通过观测的标记等位基因数目和...

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  • rzx
  • 发布于 2023-03-29 11:56
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解决Rstudio Server卡顿问题

在使用Rstudio Server出现卡顿,或者每次打开server都会加载之前的工作。 解决方法: 1. 清除工作区内项目信息 2. 在Termianal页面下删除session rm -rf ~/.local/share/rstudio/sessions...

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  • rzx
  • 发布于 2023-04-07 15:39
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R语言数据整理——tidyr包

tidyr主要提供了一个类似Excel中数据透视表(pivot table)的功能 tidyr包主要涉及: 1)长宽数据转换;2)列分割与列合并;3)缺失值的简单补齐

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-24 15:57
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R语言用tidyr包进行长宽数据转换

长型和宽型数据在数据分析中非常常见。 之前我们进行长宽数据转换使用较多的包是reshape或reshape2,原作者新推出的tidyr包对数据整合更加优秀,让我们一起来学习一下如何使用tidyr包进行长宽数据转换。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-15 18:06
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R安装units包报错解决方法

R安装units包报错解决方法

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  • 安生水
  • 发布于 2023-06-08 14:25
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pophelper包安装

pophelper包安装

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-30 10:10
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R 安装magick 报错

R 安装magick 报错

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-02-26 20:53
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flowCore R包安装报错

flowCore

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-04-17 13:44
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R magick 包安装包错

R magick 包安装包错

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-10 19:50
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ggplot 柱状图,y轴从0 开始,最高柱子 留有余地代码:

ggplot 柱状图,y轴从0 开始,最高柱子 留有余地代码:

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-06-08 17:34
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绘制PCA图时,如何删除图例中图形符号下的字母?

在使用FactoMineR和factoextra包绘制PCA图时,如果图中每个样本显示样本名,那么该图的图例中,图形符号下面会有字母,如下图左;如果图中不显示样本名,那么图例符号下面就不会有字母,如下图...

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  • rzx
  • 发布于 2023-07-12 16:26
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R脚本报错|URL 'https://raw.githubusercontent.com/YinLiLin/R-CMplot/master/R/CMplot.r': Timeout of 60 seconds was reached

在运行R脚本的时候,出现报错,提示CMplot这个包连接超时。 Error in file(filename, "r", encoding = encoding) :  cannot open the connection to 'https://raw.githubusercontent.com/YinLi...

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  • rzx
  • 发布于 2023-06-29 13:37
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使用R包(VennDiagram)进行韦恩图绘制时相关参数调整

介绍一些VennDiagram常用的绘图参数

快速生成iTOL配置文件美化你的进化树

快速生成iTOL配置文件美化你的进化树

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-11-08 10:29
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ggsci 的颜色可视化

ggsci提供了一系列高质量的调色板,让我们可以快速绘制出配色舒适的图,这些调色板的灵感来自于科学期刊、数据可视化库、科幻电影和电视节目中使用的颜色。但是这些调色板具体包含了哪些颜色呢?他们的16进制代码是什么呢?在这里,我们提供一种方法可以快速看到ggsci中各种调色板包含的颜色,便于大家随意取用与组合,使自己的图形更加美观。

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-08-09 17:37
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ggplot包中geom_histogram()报错

ggplot包中geom_histogram()报错

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  • 安生水
  • 发布于 2023-07-26 13:50
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R 包RIdeogram安装报错

安装R 包RIdeogram时需要下载rsvg,rsvg的安装出现librsvg-2.0的缺失的解决办法

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-11-10 14:49
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安装R包报错C++17

安装R包报错C++17

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  • 安生水
  • 发布于 2023-10-17 17:09
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R 相关性系数计算 cor() 报错

转录组分析时,计算完FPKM后进行相关性计算并绘图,出现报错: Error in seq.int(0, 1, length.out = n) : 'length.out' must be a non-negative number 该报错发生在选择颜色的函数colo...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-09-06 10:01
  • 阅读 ( 311 )