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单细胞转录组-inferCNV拷贝数变异分析介绍

单细胞转录组-inferCNV拷贝数变异分析介绍

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-01-10 10:52
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一文教你绘制九象限图

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  • 安生水
  • 发布于 2025-01-24 09:00
  • 阅读 ( 2757 )

Mfuzz做时间聚类分析

Mfuzz做时间聚类分析

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  • 安生水
  • 发布于 2025-01-02 16:23
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如何计算基因组中的连锁不平衡

连锁不平衡（linkage disequilibrium,LD）是指在某一个群体中，不同位置上的两个基因座同时遗传的频率明显高于预期的随机频率现象，一般用D，D'和r²来表示LD的程度。

Treemix 软件：群体基因交流分析的得力工具

在群体遗传学研究中，我们常常渴望揭开不同群体之间复杂的遗传关系以及基因流动的神秘面纱。Treemix 是一款专注于推断群体间基因流的软件。它通过构建群体遗传模型，能够有效地分析群体间的遗传...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-04-30 10:31
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samtools | 提取部分染色体的bam信息

01. samtools提取bam文件中某部分染色体相关信息 samtools view -b -h XX.bam chr1 chr4 >XX2.bam 02. samtools构建bam文件的索引 samtools index XX2.bam

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  • rzx
  • 发布于 2024-12-19 16:28
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deepseek绘图之--系统发育树

在群体遗传学研究中，构建系统发育树是解析群体遗传结构和演化历史的核心手段。无论是单核苷酸多态性（SNP）分析、单倍型网络构建，还是群体分化研究，研究者常面临一个挑战：如何将复杂的群体...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-04-30 09:42
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已知集合交集数量绘制韦恩图

大部分R包无法直接根据已知的交集数量绘制 Venn 图，必须依赖提供的集合元素列表进行计算，但是少部分R包可以，比如VennDiagram包

deepseek绘图之--微生物堆叠柱状图

在微生物组研究中，揭示群落组成与动态变化是核心任务。无论是16S rRNA测序、宏基因组分析，还是环境样本的物种丰度比较，研究者常需面对一个关键问题：如何直观展示多个样本在不同分类水平（如...

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  • xun
  • 发布于 2025-04-28 16:09
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单细胞转录组镜像代码更新4.0

单细胞转录组镜像代码更新4.0

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-01-13 11:48
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NCBI下载的10X 空间转录组数据如何读入spaceranger

spaceranger

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-05-07 13:28
  • 阅读 ( 1908 )

最全泛基因家族分析内容思路都在这里了！

泛基因家族分析发文趋势方兴未艾，越来越多的老师咨询分析内容，今天我就给大家来个高端局，将目前已有的还有未来10年即将出现的分析方向给大家罗列一下。 一、常见泛基因家族分析内容1. 基因...

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  • 红橙子
  • 发布于 2025-06-15 15:27
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IF=4.3|棉花GT64基因家族的泛基因组分析及对黄萎病的表达响应

“ 2024年9月BMC Plant Biology 杂志发表了一篇题为“Pan-genome analysis of GT64 gene family and expression response to Verticillium wilt in cotton”的泛基因家族文章。” 该文章对8种棉...

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  • rzx
  • 发布于 2025-01-24 16:20
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让AI帮你处理数据，绘制图表！让你强到可怕！

随着DeepSeek等AI人工智能的迅猛发展，我们作为新时代的生命科学从业人员也要充分利用时代红利来辅助我们的研究。今天要给大家推荐2场超实用的直播小课-《让AI帮你绘图》和《让AI帮你处理数据》...

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  • 红橙子
  • 发布于 2025-04-16 20:39
  • 阅读 ( 1747 )

空间转录组细胞共定位分析结果解读 MISTy分析

空间细胞共定位分析结果解读 MISTy分析

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-05-26 18:11
  • 阅读 ( 1712 )

在R里绘制地图

在R语言中绘制地图是数据可视化的一个重要方面，其提供了多种方法和工具包来绘制地图，包括基于经纬度数据的地图、行政区划图等。今天教大家使用ggmap、maps这两个包，进行地图的绘制。 ggmap...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-03-03 15:13
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corrplot包绘制相关性图，简单又好看！

相关性分析作为一种强大的工具，能够帮助我们量化变量间的关联程度。

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  • 安生水
  • 发布于 2025-04-16 14:43
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在凤蝶属基因组中的基因进化分析和水平基因转运(HGT)模式

“ 2024年11月《Genomics》杂志发表了一篇题为“ Genomic evolution and patterns of horizontal gene transfer in Papilio”的比较基因组文章。文章研究了11个凤蝶物种间的进化关系，分析物种...

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  • rzx
  • 发布于 2025-02-28 16:25
  • 阅读 ( 1596 )

AI写代码之批量设计引物

我们拿到一段序列之后想要设计引物通常会使用ncbi或者是primer3工具，而这些工具的在线版本都只能一个一个序列去设计，比较耗费时间，最好是使用本地版。在这里我让AI告诉我怎么做，只要阐述清...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-03-17 17:40
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R脚本绘制多层环形饼图

“ 饼图（扇形图）时常用于对统计数据的可视化，在 R中，很多R包用于绘制饼图，例如ggplot2、ggsunburst就能绘制出好看的饼图，操作如下” 1. 加载所需要的包 library(RColorBrewer)  #调色模板...

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  • rzx
  • 发布于 2025-04-27 17:35
  • 阅读 ( 1563 )