clusterprofile 支持的物种GO和KEGG富集分析orgdb
不同物种进行转录组分析的时候流程大致相同,但是当我们做的物种有一个庞大的基因组,那么流程中有一些参数需要进行修改: 1. Markdup和SplitNTrim的时候不要生成bai的索引,主要是 Markdup的...
AI 写代码之绘制GWAS 曼哈顿图
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AI助手帮我解决如何修改kvm虚拟机内存大小
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https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.08.18.456898v1.full
CAFs 细胞类型细分
人免疫细胞marker基因
HISAT和STAR比对软件比较
“ 基因的获得和丢失是基因组进化的主要驱动力。文章以所有已知的酵母基因组为数据集,研究其基因家族进化轨迹,研究结果强调了基因家族收缩在酵母代谢、基因组功能和物种形成进化中的重要作用,...
中国科学院西北高原生物所在《Molecular Ecology Resources》期刊发表最新研究论文,文章通过组装染色体水平物种基因组,群体重测序等分析,首次揭开了骆驼蓬属物种的起源、分化历史及适应性进化机制,并提出创新性的“混合-隔离-再混合 ”(MIM)循环模型
空间转录组动力学分析
“ 2025年2月 BMC Plant Biology杂志发表了一篇题为“Integrative transcriptome and metabolome analysis reveals candidate genes related to terpene synthesis in Chrysanthemum × morifolium...
获取的基因对应的蛋白序列信息是通过文件互传上传的,文件与视频教学少了个后缀是.tandem的文件。绘图时候出现报错是哪里的问题?
tensorQTL :最高效的QTL 分析工具 用法介绍
ROC 曲线绘制:
在泛基因组研究中,结构变异(SVs)的检测是揭示物种内遗传多样性的关键环节。相比单核苷酸多态性(SNPs),结构变异能够解释更多的表型差异和适应性特征。今天我们就来深入探讨泛基因组分析中...
SAW 空间转录组参考基因组制作
基因结构图是基因组学研究中最基础的可视化之一,它能帮助我们直观展示基因的外显子-内含子结构;定位突变位点、SNP位点在基因中的位置;展示不同转录本的结构差异。ggbio是基于ggplot2开发的基...