R语言基础入门—数据结构(1)

R语言基础入门—数据结构(1)

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 17:50
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NCBI下载的10X 空间转录组数据如何读入spaceranger

spaceranger

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-05-07 13:28
  • 阅读 ( 1071 )

R脚本绘制多层环形饼图

“ 饼图(扇形图)时常用于对统计数据的可视化,在 R中,很多R包用于绘制饼图,例如ggplot2、ggsunburst就能绘制出好看的饼图,操作如下” 1. 加载所需要的包 library(RColorBrewer)  #调色模板...

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  • rzx
  • 发布于 2025-04-27 17:35
  • 阅读 ( 1071 )

BaiduPCS-Go 报错 | 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit superfile2 failed

在使用BaiduPCS-Go上传文件时报错: [1] ↑ 1.03GB/1.03GB 1.81MB/s in 39s ............[1] 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit...

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  • rzx
  • 发布于 2024-12-19 17:17
  • 阅读 ( 1061 )

inferCNV 测试

inferCNV 测试

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-01-10 11:26
  • 阅读 ( 1053 )

AI助手帮我整理GEO数据库中样本信息表格

AI助手帮我整理GEO数据库中样本信息表格

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-03-14 14:35
  • 阅读 ( 1041 )

用AI写代码批量整理GEO数据库中的单细胞数据

用AI写代码只批量链接GEO 10X数据:

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-03-14 18:42
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corrplot包绘制相关性图,简单又好看!

相关性分析作为一种强大的工具,能够帮助我们量化变量间的关联程度。

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  • 安生水
  • 发布于 2025-04-16 14:43
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IF=13.8 | 甘油/二醇脱水酶是后肠发酵食肉动物肠道微生物群的关键功能

“ 2024年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Trait-based study predicts glycerol/diol dehydratases as a key function of the gut microbiota of hindgut-fermenting carnivores(Saccha...

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  • xun
  • 发布于 2024-11-13 10:44
  • 阅读 ( 1015 )

PASA 记录

PASA是我们进行基因结构预测的时候常用的软件,其最早是开发用于拟南芥的基因结构注释,目前在动植物的注释中被广泛应用。

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-05-09 10:08
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IF=5 | 健康犬的肠道微生物组和代谢组对膳食纤维的反应

2024年12月《mSystems》发表了一篇题为“Response of the gut microbiome and metabolome to dietary fiber in healthy dogs”的文章。

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  • xun
  • 发布于 2025-03-04 14:08
  • 阅读 ( 988 )

空间转录组数据挖掘流程记录-甲状腺癌(GSE250521)

空间转录组数据挖掘流程记录-甲状腺癌(GSE250521)

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-04-08 14:31
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组学大讲堂云服务器conda环境配置:

组学大讲堂云服务器conda环境配置:

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-02-20 11:47
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拟南芥叶单细胞分析流程

拟南芥单细胞分析流程

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-01-23 14:41
  • 阅读 ( 960 )

openssl 安装

https://openssl-library.org/source/old/3.0/index.html

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-12-18 14:29
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非模式物种10X空间转录组单细胞参考基因组构建

非模式物种10X空间转录组单细胞参考基因组构建

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-01-14 16:09
  • 阅读 ( 922 )

Metadata CRC error detected at xfs _ bmbt _ read _ verify+0x12/0xb0 [xfs], xfs _ bmbt block 0xc9132f8 [ 4.863216] XFS(dm-0): Unmount and run xfs _ repair

Metadata CRC error detected at xfs _ bmbt _ read _ verify+0x12/0xb0 [xfs], xfs _ bmbt block 0xc9132f8 [ 4.863216] XFS(dm-0): Unmount and run xfs _ repair

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-01-09 11:26
  • 阅读 ( 920 )

linux 编码转换

在linux里面编辑二进制文件有以下两种方法: 1. vim 打开二进制文件: vim -b 文件 将内容转换成16进制: :%!xxd 转换回来: :%!xxd -r  2. iconv  # 将UTF-8编码的wx.txt文件转换为GB...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-12-03 14:56
  • 阅读 ( 920 )

不均等坐标系绘制

    通常来说,进行图片绘制的时候如果存在数据分布差异过大的情况,我们更倾向于选择坐标系截断(gg.map等)的方式去展示于结论更加相关的信息。但是截断毕竟会损失部分信息,如果想要更加全面...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-01-10 17:10
  • 阅读 ( 918 )

annovar的染色体识别问题

如果是非数字形式的染色体编号(尤其是其中有特殊字符),annovar的注释可能会有问题,需要改成数字格式