从fasta基因组中提取反向互补序列

从fasta基因组中提取反向互补序列,借助bedtools工具。 bedtools getfasta -fi Dlong_asm_chr.fasta -bed DlNIP.bed -s -fo DlNIP.bed.fa -fi 基因组文件     -bed 基因位置 共6列:【染色...

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  • rzx
  • 发布于 2023-02-27 14:22
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基因组注释流程,PASA mysql 数据库启动 exited

基因组注释流程,PASA mysql 数据库启动 exited

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-21 18:03
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blastn使用方法及结果详解

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  • 星莓
  • 发布于 2023-09-20 15:19
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muscle新版,旧版使用的一些差别

muscle新版,旧版使用的一些差别

叶绿体/线粒体散在重复序列注释——REPuter

REPuter可注释叶绿体重复序列,包括4种类型,Forward(F), Reverse (R), Complement (C), Palindromic (P)。 REPuter 是可在线注释, 详情可参考文献  REPuter: the manifold applications of...

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  • 星莓
  • 发布于 2023-10-11 15:30
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【Linux】查看文件中的某几行(中间几行)

【Linux】查看文件中的某几行(中间几行)

vim显示行号、跳转到指定行或列

一、显示行号 命令模式输入 :set nu或:set number Tips:如果要设置每个打开的文件都默认显示行号,则使用vi编辑~/.vimrc文件或者/etc/vimrc文件,在该文件中加入一行set nu,保存并退出...

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  • 星莓
  • 发布于 2023-07-19 13:50
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perl语言USAGE 标记

perl语言USAGE 标记

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-03 14:28
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string数据库下载的文件

string数据库下载的文件表头比较复杂,我给大家写一份说明书 1,neighborhood_on_chromosome: 这个特征表示在基因组中,两个基因是否靠近彼此,通常使用染色体上的物理距离来确定。如果两个...

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  • xun
  • 发布于 2023-03-06 15:51
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pophelper包安装

pophelper包安装

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-30 10:10
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三代数据SV检测软件安装与使用——cuteSV

三代测序在检测基因组结构变异方面有着很大的优势,但是由于数据分析算法、软件还处于不断开发更新中,当前还没有公认推荐的软件。这里为大家推荐一款国人开发的三代数据SV检测软件—cuteSV。该...

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  • 星莓
  • 发布于 2023-04-28 14:14
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Rush:一款强大的Linux并行任务执行工具

Rush(Rapid Utilities SHell)是一款强大的并行任务执行工具,专门设计用于在Linux或Unix环境中进行批处理任务。该工具的设计初衷是为了使并行处理和任务管理变得更为简洁明了,同时具备灵活性...

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  • xun
  • 发布于 2023-06-20 14:15
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Docker 使用容器来创建更新镜像

Docker 使用容器来创建镜像

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-20 20:51
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服务器docker防止退出之后容器杀死导致任务中断

podman 防止退出之后容器杀死:

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-04-22 09:50
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使用vcftools对vcf文件做滑窗处理

使用vcftools对vcf文件做滑窗处理

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  • 安生水
  • 发布于 2023-04-26 10:13
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Argument list too long报错

Argument list too long报错

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  • 安生水
  • 发布于 2023-08-21 11:01
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百度网盘 for Linux ——BaiduPCS-Go用法

常使用linux,但仍然需要百度网盘和外界进行沟通的用户一定知道bypy,不过遗憾的是,这个软件python写的软件太过缓慢,不过我最近发现了一个软件,BaiduPCS-Go 他用go编写,几乎像是百度网盘li...

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  • xun
  • 发布于 2023-07-14 17:13
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grep --color=auto使用用法介绍

grep是一个常用的文本搜索工具,用于在文件中查找文本字符串。grep--color=auto是grep的一个扩展选项,主要功能是匹配的特定字符串加上颜色以区分,并可以进行高亮显示。可以方便我们快速查找相...

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  • 安生水
  • 发布于 2023-06-26 14:49
  • 阅读 ( 695 )

计算RNASeq 的Power值

计算RNASeq 的Power值

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  • 安生水
  • 发布于 2023-05-29 13:25
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jcvi微共线区域(Microsynteny)可视化

如何使用jcvi通过调整相关文件参数展示局部共线性情况