如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组,然后使用filter函数结合any函数来判断每个分组是否满足特定条件并进行过滤。
报错: 运行HiC-Pro的时候出现报错: 去看log文件发现: 只能知道是在比对的step1就出现了问题。 问题查找: 此时我们需要去HiC-Pro的scripts文件夹下面去查看Makefile这个文件,看一...
SRA Toolkit 是一套由 NCBI (National Center for Biotechnology Information) 开发的软件工具,用于从 SRA (Sequence Read Archive) 数据库下载和处理生物序列数据。
unable to load shared object '/home/wanghj/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/00LOCK-igraph/00new/igraph/libs/igraph.so': libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such fi...
单细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中
在群体遗传学研究中,构建系统发育树是解析群体遗传结构和演化历史的核心手段。无论是单核苷酸多态性(SNP)分析、单倍型网络构建,还是群体分化研究,研究者常面临一个挑战:如何将复杂的群体...
非小细胞肺癌 (GSE139555)
pfamscan程序-translate和python的translate冲突
“ 2024年8月《BMC Plant Biology》发表了一篇题为“SOS1 gene family in mangrove (Kandelia obovata): Genome-wide identification, characterization, and expression analyses under salt and...
“ 2024年9月BMC Plant Biology 杂志发表了一篇题为“Pan-genome analysis of GT64 gene family and expression response to Verticillium wilt in cotton”的泛基因家族文章。” 该文章对8种棉...
非小细胞肺癌(GSE148071)
连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)是指在某一个群体中,不同位置上的两个基因座同时遗传的频率明显高于预期的随机频率现象,一般用D,D'和r²来表示LD的程度。
有的文章会在模块化的群落里加上Convex Hull ,类似这样,如何实现呢,可以借助ggforce的geom_mark_hul 比如我们的示例代码稍作修改 library(ggforce) 主要是加了最后一行,的geom_mark_hull...
基因展示图时如何设置细胞排布顺序
准备eQTL分析的协变量文件
R语言基础入门—数据结构(2)
hisat2-build报错:Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)
蛋白质比对结果快速分类taxid的c脚本
MITE属于II类非自主转座因子,可以使用MITE_Hunter进行检测,MITE_Hunter的运行一共有8步。 1. 报错信息 在运行第六步(-S 6)的时候出现报错: 2. 报错原因 发现第六步执行: 在MITE_...
glimmhmm是一个基因从头预测的软件,他的运行需要先训练模型再预测基因 报错: 运行trainGlimmerHMM的时候出现报错”undefined symbol: Perl_xs_handshake“ 问题: per调用的lib里面没有相关...