基因组重复序列分类 转座子

基因组重复序列分类

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• 发布于 2022-09-06 10:27
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蛋白质的理化性质除了用Expasy网站还能用TBtools等分析

基因家族，理化性质分析

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• 生信阿姨
• 发布于 2022-09-02 14:28
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基因组Hic挂载AGP文件格式说明

基因组Hic挂载AGP文件格式说明

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• 发布于 2022-07-20 17:20
• 阅读 ( 553 )

基因组版本 Primary 和 Alternate的区别

Alternate

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• 发布于 2022-08-18 18:37
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组装好的基因组通过agp文件得到contig序列

https://github.com/tanghaibao/jcvi/issues/391

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• 发布于 2022-11-17 20:33
• 阅读 ( 377 )

基因组注释分析方法

基因组注释分析方法

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• 发布于 2022-11-02 10:42
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repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件，可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽

repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件，可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽

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• 发布于 2022-12-07 10:13
• 阅读 ( 295 )

Braker 有转录组数据预测基因 多样本转录组

多样本转录组

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• 发布于 2022-11-02 17:31
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contig or scaffold GFF 文件通过AGP文件转换成 染色体 gff文件

contig GFF 文件通过AGP文件转换成 染色体 gff文件

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• 发布于 2022-11-17 21:14
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根据GFF文件提取基因组中基因的蛋白，CDS，CDNA序列

https://github.com/TransDecoder/TransDecoder

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• 发布于 2022-12-28 11:52
• 阅读 ( 219 )

全基因加倍/复制（whole genome duplication, WGD）

全基因加倍/复制（whole genome duplication, WGD）

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• 发布于 2023-03-02 17:24
• 阅读 ( 172 )

真菌 ncRNA 基因特征及坚定方法

Haas BJ, Zeng Q, Pearson MD, Cuomo CA, Wortman JR. Approaches to Fungal Genome Annotation. Mycology. 2011 Oct 3;2(3):118-141. doi: 10.1080/21501203.2011.606851. PMID: 22059117; PMCID: PMC3207268.

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• 发布于 2022-11-30 14:07
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利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树mcmctree

利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树

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• 发布于 2023-02-27 20:46
• 阅读 ( 166 )

Repeat masking in MAKER2 (difference with BRAKER2)

Repeat masking in MAKER2 (difference with BRAKER2)

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• 发布于 2022-11-10 10:46
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有根树和无根树newick文件中

有根树和无根树newick文件中

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• 发布于 2023-02-09 14:07
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核苷酸替换模型-GTR是所有模型中考虑参数最多最复杂的模型，其他所有模型是GTR模型的特例

GTR是所有模型中考虑参数最多最复杂的模型，其他所有模型是GTR模型的特例

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• 发布于 2023-02-02 15:14
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最全进化树构建知识点大盘点

最全进化树构建知识点大盘点

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• 发布于 2023-03-10 15:56
• 阅读 ( 146 )

OrthoFinder 输出结果文件说明

OrthoFinder 输出结果文件说明

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• 发布于 2023-03-13 14:12
• 阅读 ( 67 )

synteny collinearity 区别

synteny collinearity 区别

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• 发布于 2023-02-23 17:01
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