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IF=5.7 | 转录组数据揭示类风湿关节炎的临床诊断模型

​“ 2024年6月Frontiers in immunology 杂志发表了一篇题为Integrated analysis of single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, Mendelian randomization, and eQTL reveals T cell-related nomogram mo...

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  • 发布于 2024-07-30 15:50
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RunUMAP函数报错,

执行降维分析的函数,umpa的时候报错 brain <- RunUMAP(brain, reduction = "pca", dims = 1:30) 报错信息如下: Error in irlba::irlba(L, nv = n, nu = 0, maxit = iters) :   function '...

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  • 发布于 2024-07-25 14:15
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单细胞转录组-inferCNV拷贝数变异分析介绍

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  • 发布于 2025-01-10 10:52
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-非小細胞肺癌（NSCLC）(GSE127465)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-癌（NSCLC）(GSE127465)

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  • 发布于 2024-07-24 11:11
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B/T细胞分类：

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  • 发布于 2024-07-25 09:50
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BLCA膀胱癌(GSE192575)

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  • 发布于 2024-06-27 11:44
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R语言跑循环，如何跳过报错信息？

当使用循环跑R函数的时候，如果其中某一次循环执行时报错，那么就会中断循环体，并在屏幕上打印出报错信息

从tar压缩文件夹中仅提取某一个目标文件

有时候我们需要从tar压缩文件夹中仅提取某个目标文件，如果对整个压缩文件进行解压的话，未免太占用空间和资源，我们可以使用如下命令进行操作

IF=4.9 | 多倍体割手密IAA基因家族分析鉴定

​“ 2024年7月国际分子科学杂志(International Journal of Molecular Sciences)发表了一篇题为“ Genome-Wide Analysis of the Auxin/Indoleacetic Acid(Aux/IAA) Gene Family in Autopolyploid...

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  • 发布于 2024-08-29 15:55
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE146771)

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  • 发布于 2024-07-24 16:38
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107)

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  • 发布于 2024-06-27 13:33
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单细胞转录组镜像代码更新4.0

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  • 发布于 2025-01-13 11:48
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VScode文档列对齐插件-code alignment

一款VScode中文档列对齐的插件

单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)

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  • 发布于 2024-07-25 11:01
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samtools | 提取部分染色体的bam信息

01. samtools提取bam文件中某部分染色体相关信息 samtools view -b -h XX.bam chr1 chr4 >XX2.bam 02. samtools构建bam文件的索引 samtools index XX2.bam

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  • 发布于 2024-12-19 16:28
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Upset图绘制

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 16:27
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组装"预实验" | 物种倍性分析

倍性直接影响基因组的大小和复杂性，不同倍性的物种需要不同的组装策略，了解物种的倍性对于基因组组装至关重要

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-11-25 15:22
  • 阅读 ( 1142 )

绘制全基因组甲基化图谱

绘制全基因组甲基化图谱

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  • 安生水
  • 发布于 2024-07-25 14:08
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空间转录组数据预处理

​空间转录组简介 空间转录组，顾名思义，是在转录组的基础上加上了空间位置信息。如果不借助空间的技术,我们的转录组一般是粉碎组织到细胞层级或者更低的rna碎片层级,而进行sc RNA或者Bulk...

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  • xun
  • 发布于 2024-07-02 15:56
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-CRC直肠癌(GSE178341)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-CRC直肠癌(GSE178341)

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  • 发布于 2024-06-27 14:03
  • 阅读 ( 1128 )