“ 2025年12月 Frontiers in plant science杂志发表了一篇题为“Genome-wide characterization of WRKY family genes in four araceae species and their expression analysis in Amorphophallu...
宏基因组的基因组binning(分箱,即将测序数据中的reads或contigs分类到不同的基因组中)是一个关键步骤, 常用的软件是2018发表的metawrap,但是他一直没有更新, 这篇文章将介绍一个较新的binnin...
单细胞转录组数据挖掘流程记录-LUAD(GSE131907)
报错提示: Fatal LIMIT error: the number of junctions to be inserted on the fly =1412348 is larger than the limitSjdbInsertNsj=1000000Fatal LIMIT error: the number of junctions to...
目前主流的探究转录组数据的可变剪切的算法是基于estimate isoform ratios 或者 exon inclusion levels ,但是可变剪切本跟正常转录本重合的比例很大,存在技术误差也,且他依赖于基因现有的注释...
大多数人在服务器上运行命令的时候,爱使用循环或者逐条运行,这其实无法发挥服务器的性能,在不用花的时间上浪费了很多时间,本期我们来从简入难,汇总一下服务器并行的思路 01 — 基础并行,不...
张泽民 生信文章
单细胞转录组数据挖掘流程记录-LUAD(GSE123902)
报错原因: PfamScan运行的时候会调用hmmer的translate,而在我环境中默认是python下面的translate 解决办法: export PATH=/biosoft/hmmer/squid/:$PATH
报错内容: ImportError: cannot import name 'romberg' from 'scipy.integrate' 可以看一下,基本上是这个脚本的第六行存在调用: ~/biosoft/conda/miniconda3/lib/python3.12/site-package...
rocky9 手动安装新罗马字体
肺癌细胞类型marker基因
小鼠单细胞转录组方法
IF=4.2 | 杏黄李关键耐寒代谢途径的转录组代谢组联合分析
IBD(Identity by Descent,同源片段分析)是群体遗传学中用于检测个体间共享祖先片段的分析方法。 一、IBD分析的基本概念 IBD分析是通过检测基因组中共享的、未发生重组的DNA片段,推断个体...